224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0887 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1567  PEBP family protein  44.56 
 
 		 195 aa  140  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  38.86 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  40.21 
 
 		 190 aa  135  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  38.62 
 
 		 190 aa  135  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  38.1 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  37.04 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  36.41 
 
 		 187 aa  114  7.999999999999999e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  35.26 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  38.31 
 
 		 194 aa  97.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  37.74 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  36.48 
 
 		 153 aa  94.7  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  39.16 
 
 		 181 aa  94.4  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  37.74 
 
 		 179 aa  93.6  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  36.48 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  35.95 
 
 		 157 aa  92  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  37.27 
 
 		 157 aa  91.7  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  33.55 
 
 		 156 aa  91.3  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  37.09 
 
 		 617 aa  90.9  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  31.07 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  35.62 
 
 		 157 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  32.95 
 
 		 176 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  30.67 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  37.18 
 
 		 156 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  36.36 
 
 		 191 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  34.64 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  35.85 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  30.67 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  33.55 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6091  PEBP family protein  32.18 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  35.03 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  33.54 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  34.64 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  33.69 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  35.1 
 
 		 150 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  34.39 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  32.91 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  31.45 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  30.54 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  31.54 
 
 		 154 aa  77.8  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  32.62 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  35.71 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  35.4 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  31.82 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  34.39 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  34 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  29.01 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32114  predicted protein  28.92 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.223556  normal  0.54599 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  34.18 
 
 		 157 aa  72  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  34 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  30.67 
 
 		 155 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  32.26 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  33.55 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  33.77 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.442467 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  32.68 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  31.21 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  30.38 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  32.45 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  29.8 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  32.65 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  33.11 
 
 		 150 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  30.54 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  36.52 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  33.33 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  31.21 
 
 		 155 aa  65.9  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  36.2 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  28.48 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  30.67 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  30.57 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  26.58 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  30.72 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  30.72 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  37.34 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  41.86 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  27.22 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  33.33 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3488  PEBP family protein  28.4 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274615  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  27.5 
 
 		 173 aa  62  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  36.31 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  29.75 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  28.48 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  32.11 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3163  PBP family phospholipid-binding protein  31.21 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.650541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3225  PBP family phospholipid-binding protein  31.21 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3175  PBP family phospholipid-binding protein  31.21 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  32.26 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  31.37 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  34.58 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  28.67 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5877  PEBP family protein  32 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12230  conserved hypothetical protein TIGR00481  38 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.888512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3288  PEBP family protein  28.47 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0439012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  33.57 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  28.12 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  28.68 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  30.46 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  31.85 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2129  PEBP family protein  33.03 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  31.85 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>