262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3733 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 
184 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  50.96 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  50.96 
 
 
158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  49.68 
 
 
183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  45.36 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  49.38 
 
 
187 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  49.38 
 
 
187 aa  154  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  49.68 
 
 
189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  46.01 
 
 
188 aa  144  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  44.3 
 
 
186 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  40.12 
 
 
179 aa  104  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  40.56 
 
 
185 aa  103  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  37.97 
 
 
183 aa  99.8  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  34.24 
 
 
173 aa  99  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  38.61 
 
 
184 aa  98.2  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  35.56 
 
 
206 aa  97.8  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  34.16 
 
 
156 aa  97.1  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  38.89 
 
 
158 aa  96.3  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  30.1 
 
 
193 aa  94.4  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  35.91 
 
 
182 aa  92  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  34.81 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  40.3 
 
 
182 aa  91.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  37.04 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  39.55 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  35.58 
 
 
159 aa  90.1  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  39.55 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  39.55 
 
 
182 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  39.55 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  36.36 
 
 
157 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  32.78 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0985  PEBP family protein  35.54 
 
 
189 aa  88.2  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.340221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  34.81 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  37.04 
 
 
181 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  32.35 
 
 
181 aa  88.2  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  35.76 
 
 
154 aa  87.8  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8369  PEBP family protein  40 
 
 
199 aa  87.8  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632838  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  35.19 
 
 
157 aa  87.8  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  36.25 
 
 
617 aa  87  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  33.94 
 
 
179 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0033  PBP family phospholipid-binding protein  36.54 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  36.02 
 
 
159 aa  85.5  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  35.71 
 
 
153 aa  85.5  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  35.56 
 
 
181 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  34.81 
 
 
149 aa  84.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  34.81 
 
 
175 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  34.81 
 
 
175 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2434  PEBP family protein  36.23 
 
 
181 aa  84.7  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0392819  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  32.29 
 
 
185 aa  84.7  7e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00495  predicted kinase inhibitor  37.59 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.325407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00500  hypothetical protein  37.59 
 
 
183 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.269505  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  38.03 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  35.11 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  38.03 
 
 
164 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38600  phospholipid-binding protein, PBP family  39.53 
 
 
182 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  33.93 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  32.93 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  37.9 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  33.95 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0594  hypothetical protein  33.97 
 
 
180 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  33.97 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  34.18 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  33.54 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2035  putative kinase inhibitor  37.98 
 
 
183 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  35.44 
 
 
150 aa  82  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  35.37 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  37.8 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  32.95 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  34.42 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2774  PBP family phospholipid-binding protein  37.24 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.504548  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  32.12 
 
 
150 aa  81.3  0.000000000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  35.16 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  35.16 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  34.29 
 
 
206 aa  80.9  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  36.48 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  36.67 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  33.33 
 
 
155 aa  80.5  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  34.36 
 
 
159 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  31.01 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  35.71 
 
 
179 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1992  PEBP family protein  29.55 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  34.18 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  32.91 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  36.2 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  35 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  33.12 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  31.9 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  32.53 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  32.91 
 
 
149 aa  79  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  32.91 
 
 
156 aa  79  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  30.63 
 
 
155 aa  79  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  34.39 
 
 
150 aa  79  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  29.63 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0858  PEBP family protein  32.5 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  32.54 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  29.63 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0019  PEBP family protein  40.78 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3038  PEBP family protein  35.04 
 
 
178 aa  77.4  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  32.14 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1447  PEBP family protein  31.84 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2043  PEBP family protein  35.8 
 
 
180 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>