228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0133 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  100 
 
 
190 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  54.5 
 
 
190 aa  203  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  53.97 
 
 
190 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  54.5 
 
 
190 aa  197  5e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  52.6 
 
 
210 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  45.55 
 
 
207 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0887  PEBP family protein  40.21 
 
 
190 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.266147 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1567  PEBP family protein  44.38 
 
 
195 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.627481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  38.96 
 
 
176 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  39.46 
 
 
187 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  37.01 
 
 
176 aa  100  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  38.56 
 
 
153 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  33.97 
 
 
194 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  33.93 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  35.06 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  40.54 
 
 
181 aa  94.4  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  39.24 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  38.75 
 
 
156 aa  92  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  36.6 
 
 
153 aa  92  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6091  PEBP family protein  39.2 
 
 
174 aa  90.5  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  33.97 
 
 
157 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  36.42 
 
 
157 aa  89  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  35.9 
 
 
185 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  34.81 
 
 
179 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  36.63 
 
 
617 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  41.51 
 
 
159 aa  85.5  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  33.12 
 
 
191 aa  85.1  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  38.04 
 
 
159 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  38.04 
 
 
159 aa  84.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  34.62 
 
 
150 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  35.85 
 
 
158 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  32.08 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  36.6 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3048  hypothetical protein  31.06 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314346  normal  0.708651 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  33.77 
 
 
154 aa  82  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  36.54 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  34.18 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  29.49 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  33.12 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  36.54 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32114  predicted protein  29.5 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.223556  normal  0.54599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  32.91 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  36.18 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  31.46 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  36.54 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  34.23 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  36.54 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  32.92 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  29.56 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  32.47 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  34.39 
 
 
150 aa  75.9  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  27.39 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  31.65 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  37.42 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  37.58 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  37.58 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  29.09 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  34.62 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2785  PEBP family protein  34.59 
 
 
183 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.252116  normal  0.340055 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  32.47 
 
 
175 aa  74.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  30.77 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  32.67 
 
 
150 aa  73.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3081  PEBP family protein  34.59 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.625763  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  33.74 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  31.01 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  36.47 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  34.87 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  36.75 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2643  PEBP family protein  34.59 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  31.01 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  35.44 
 
 
157 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  28.57 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  31.06 
 
 
182 aa  72  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  39.87 
 
 
159 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0634  PEBP family protein  29.17 
 
 
268 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.731685  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0606  PEBP family protein  29.17 
 
 
268 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  31.58 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  32.92 
 
 
179 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  32.92 
 
 
159 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  41.41 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  30.13 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2899  PEBP family protein  30.34 
 
 
218 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.970699  normal  0.309684 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  32.28 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  40.16 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3733  PBP family phospholipid-binding protein  32.3 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  26.75 
 
 
173 aa  68.6  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  30.92 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  39.24 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  35.37 
 
 
189 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0182  PBP family phospholipid-binding protein  32.18 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.333114  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  30.43 
 
 
182 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  37.98 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  29.87 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  30.82 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  38.61 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2489  PEBP family protein  32.92 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.182632 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  29.68 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  29.19 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  30.86 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  30.25 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>