230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1950 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  100 
 
 
185 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2899  PEBP family protein  44.75 
 
 
218 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.970699  normal  0.309684 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  44.85 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  38.89 
 
 
188 aa  131  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  43.2 
 
 
169 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  43.8 
 
 
181 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  37.33 
 
 
157 aa  97.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  36.55 
 
 
193 aa  95.5  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  35.46 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  33.33 
 
 
176 aa  90.9  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  35.46 
 
 
153 aa  89  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  35.9 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  34.42 
 
 
206 aa  85.5  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  33.15 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  37.19 
 
 
201 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  34.9 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  34.23 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  37.82 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  36.36 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  31.02 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  41.18 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  33.77 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  36.3 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  34.15 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  39.82 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  35.61 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  35.66 
 
 
157 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  36.67 
 
 
150 aa  77.4  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  34.13 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  36.07 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  30.99 
 
 
154 aa  75.9  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  34.13 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0344  PEBP family protein  40.52 
 
 
152 aa  75.5  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  32.47 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  38.14 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  34.43 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  35.57 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  37.82 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0671  PEBP family protein  32.91 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636068  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  35 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0693  PBP family phospholipid-binding protein  32.91 
 
 
164 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0102847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  38.02 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  29.14 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  35.04 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  37.5 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  31.67 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  38.66 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  28.47 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  31.25 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  37.1 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  38.1 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  31.13 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  32.69 
 
 
190 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  31.1 
 
 
184 aa  71.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  31.43 
 
 
617 aa  71.6  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  39.84 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  30.43 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  39.84 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  33.1 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  33.1 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  34.31 
 
 
191 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  36.21 
 
 
156 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  32.81 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3869  PBP family phospholipid-binding protein  30 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0607284 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  30.52 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  30.49 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3314  PEBP family protein  32.91 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  33.79 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6437  PEBP family protein  33.33 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.729051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  30.82 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  29.68 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00740  predicted kinase inhibitor  30.82 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0173432  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2869  PEBP family protein  30.82 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2870  putative kinase inhibitor protein  30.82 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0113599  normal  0.0521651 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0827  putative kinase inhibitor protein  30.82 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000771777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00757  hypothetical protein  30.82 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0836  putative kinase inhibitor protein  30.82 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.145482  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  33.52 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  29.55 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  33.04 
 
 
150 aa  67  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  33.33 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  30.71 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  33.56 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  30.19 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  32.21 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2579  putative kinase inhibitor protein  30.19 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0939329  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  33.33 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  37.67 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0061  PEBP family protein  35.34 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.758418  normal  0.36925 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1488  PEBP family protein  34.55 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  33.04 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  30.77 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  33.09 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0942  putative kinase inhibitor protein  31.45 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8937  PEBP family protein  31.37 
 
 
173 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.995518  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  30.19 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0828  putative kinase inhibitor protein  30.82 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354915  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3665  PBP family phospholipid-binding protein  29.3 
 
 
182 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0887  putative kinase inhibitor protein  30.82 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>