255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1784 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  42.55 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  42.55 
 
 
176 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  46 
 
 
191 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  46 
 
 
155 aa  116  9e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  44.14 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  43.45 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  42.55 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  41.1 
 
 
156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  36.84 
 
 
185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  37.01 
 
 
193 aa  113  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  43.06 
 
 
175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  42.36 
 
 
175 aa  110  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  42.55 
 
 
194 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  40.94 
 
 
150 aa  107  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  39.19 
 
 
156 aa  107  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  39.74 
 
 
179 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  40.52 
 
 
188 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  41.98 
 
 
200 aa  105  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  39.22 
 
 
157 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  36.94 
 
 
156 aa  103  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  39.69 
 
 
181 aa  103  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  37.33 
 
 
149 aa  102  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  37.16 
 
 
154 aa  103  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  38.73 
 
 
191 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  37.66 
 
 
150 aa  101  3e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  37.33 
 
 
149 aa  101  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  39.58 
 
 
155 aa  102  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  38.96 
 
 
150 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  39.07 
 
 
206 aa  101  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  38.26 
 
 
150 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  38.26 
 
 
150 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  39.46 
 
 
201 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  38.31 
 
 
150 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  38.56 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  37.97 
 
 
158 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  39.16 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  36.91 
 
 
617 aa  95.1  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  37.5 
 
 
210 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  35.14 
 
 
158 aa  94  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  34.46 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  35.62 
 
 
149 aa  92  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  37.24 
 
 
184 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  37.41 
 
 
204 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  36.11 
 
 
181 aa  90.9  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  38.26 
 
 
158 aa  90.1  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  37.82 
 
 
179 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  38.64 
 
 
183 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  36.13 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  36.08 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  36.08 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0873  PBP family phospholipid-binding protein  39.19 
 
 
207 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547082  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  36.84 
 
 
190 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  33.33 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0929  PBP family phospholipid-binding protein  35.44 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  35.71 
 
 
185 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  37.97 
 
 
159 aa  84.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0923  PEBP family protein  33.99 
 
 
190 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.748073  normal  0.344999 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  38.71 
 
 
187 aa  84  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  41.3 
 
 
177 aa  83.6  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  32.67 
 
 
185 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  37.04 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  38.64 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  36.43 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  31.37 
 
 
180 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  36.05 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  31.97 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  33.33 
 
 
150 aa  82  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  37.21 
 
 
181 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  30.92 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  33.33 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  37.01 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4169  PEBP family protein  33.33 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3974  PEBP family protein  33.33 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7099  PEBP family protein  36.72 
 
 
189 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4051  PEBP family protein  33.33 
 
 
179 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0756  PBP family phospholipid-binding protein  34.87 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.439092  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0898  PEBP family protein  31.37 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  35.07 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  34.23 
 
 
190 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0960  PEBP family protein  32.03 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0174403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0316  phosphatidylethanolamine-binding protein  33.82 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0803  PEBP family protein  34.87 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  31.76 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  30.92 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  32.37 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0280  PBP family phospholipid-binding protein  32.14 
 
 
182 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0807  PEBP family protein  34.21 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1917  PEBP family protein  35.48 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.184289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  31.67 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  36.99 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1190  hypothetical protein  36.57 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4088  PEBP family protein  33.33 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138145  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  36.22 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4200  PEBP family protein  33.33 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1039  hypothetical protein  36.57 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.584639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1144  hypothetical protein  36.3 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.11356  normal  0.247575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1122  hypothetical protein  35.56 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  9.45628e-18 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  30.5 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1156  hypothetical protein  35.56 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.245103  normal  0.982011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>