205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2306 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2306  PEBP family protein  100 
 
 
169 aa  344  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.369465  normal  0.318834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6791  Phospholipid-binding protein-like protein  54.39 
 
 
188 aa  188  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.441972  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1681  PEBP family protein  45.12 
 
 
192 aa  131  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000112959  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1950  PBP family phospholipid-binding protein  43.67 
 
 
185 aa  117  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.141097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2899  PEBP family protein  40.33 
 
 
218 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.970699  normal  0.309684 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1009  PBP family phospholipid-binding protein  40.97 
 
 
176 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1648  PEBP family protein  38.89 
 
 
176 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00261861  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2814  PBP family phospholipid-binding protein  40.97 
 
 
194 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.581391  normal  0.0487797 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2099  PEBP family protein  40.29 
 
 
181 aa  101  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000417914  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11940  lipoprotein lppC  42.15 
 
 
201 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0791  PEBP family protein  33.33 
 
 
193 aa  97.1  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.259188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0267  PEBP family protein  38.13 
 
 
153 aa  97.1  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368658  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11939  hypothetical protein  39.44 
 
 
204 aa  94  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5858  PEBP family protein  39.57 
 
 
156 aa  91.3  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0880759  normal  0.677291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4067  PEBP family protein  36.91 
 
 
149 aa  90.5  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.942743 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0074  PEBP family protein  36.81 
 
 
149 aa  90.5  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0109  hypothetical protein  35.86 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.337531  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0696  PEBP family protein  33.33 
 
 
173 aa  89  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0547284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3959  PEBP family protein  35.81 
 
 
153 aa  88.6  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0764  PEBP family protein  31.25 
 
 
185 aa  88.6  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.122242  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1593  hypothetical protein  36.23 
 
 
149 aa  87.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1406  hypothetical protein  35.51 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2134  hypothetical protein  33.57 
 
 
175 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3871  PEBP family protein  35.14 
 
 
153 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2160  hypothetical protein  33.57 
 
 
175 aa  86.3  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4111  PBP family phospholipid-binding protein  30.98 
 
 
200 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.135961 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1927  PEBP family protein  33.1 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0091  PEBP family protein  34.9 
 
 
156 aa  83.6  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0857  PEBP family protein  35.03 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0395  hypothetical protein  31.25 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2696  PEBP family protein  37.5 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4072  PEBP family protein  32.93 
 
 
183 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.442467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2650  PEBP family protein  39.06 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0593968  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2051  PBP family phospholipid-binding protein  34.04 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0579  PEBP family protein  34.51 
 
 
184 aa  80.9  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3420  PEBP family protein  36.81 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1008  PBP family phospholipid-binding protein  35.21 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1512  PEBP family protein  38.71 
 
 
179 aa  79  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.701821  normal  0.397835 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  35.57 
 
 
617 aa  79  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1391  hypothetical protein  32.65 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00305755  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1321  PEBP family protein  34.07 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0141  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4115  PEBP family protein  33.56 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.151806 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4227  PEBP family protein  33.56 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.91737  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0194  PEBP family protein  32.21 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00231088  decreased coverage  0.000228526 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1784  YbhB and YbcL  32.37 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2885  PEBP family protein  35.76 
 
 
157 aa  74.7  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246292  normal  0.313243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1951  conserved hypothetical protein TIGR00481  30.82 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.568523  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_473  phosphatidylethanolamine-binding protein  31.76 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0945  PEBP family protein  34.33 
 
 
192 aa  74.3  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16900  conserved hypothetical protein TIGR00481  33.58 
 
 
181 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117094  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1620  PEBP family protein  31.29 
 
 
155 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4021  PEBP family protein  33.56 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00411793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1826  PEBP family protein  32.17 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0508  PBP family phospholipid-binding protein  31.08 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3239  YbhB and YbcL  35.21 
 
 
207 aa  70.9  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3483  PEBP family protein  40.18 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1038  PEBP family protein  35.12 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4302  PEBP family protein  33.14 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4564  PEBP family protein  37.4 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0532  phosphatidylethanolamine-binding protein, putative  29.73 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.201907  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1789  PBP family phospholipid-binding protein  39.77 
 
 
177 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1458  PEBP family protein  35.48 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0354948  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01998  hypothetical protein  32.68 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.43603  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1171  YbhB and YbcL  31.54 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2615  YbhB and YbcL  34.64 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2383  PEBP family protein  33.33 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3147  PEBP family protein  31.72 
 
 
150 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.054445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1177  PBP family phospholipid-binding protein  30.77 
 
 
188 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1605  hypothetical protein  34.15 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.466009  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0135  YbhB and YbcL  31.62 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1202  PEBP family protein  30.67 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1794  PEBP family protein  31.21 
 
 
210 aa  63.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2360  PBP family phospholipid-binding protein  28.77 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0008  PEBP family protein  32.91 
 
 
185 aa  62.8  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3134  PEBP family protein  32.94 
 
 
206 aa  62  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2270  PEBP family protein  29.33 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0505873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3047  hypothetical protein  34.39 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2069  PEBP family protein  31.17 
 
 
158 aa  61.2  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3676  PEBP family protein  31.62 
 
 
156 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1597  PEBP family protein  29.94 
 
 
183 aa  60.8  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.82719  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4277  PEBP family protein  32.88 
 
 
153 aa  60.8  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246525  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1506  PBP family phospholipid-binding protein  32.84 
 
 
190 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000587287  hitchhiker  0.0000712833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04720  phospholipid-binding protein, PBP family  31.79 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.583132  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0871  PEBP family protein  31.33 
 
 
177 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.393701 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2903  PEBP family protein  33.6 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4884  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3229  PBP family phospholipid-binding protein  31.51 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0344  PEBP family protein  34.15 
 
 
152 aa  59.3  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0796  putative kinase inhibitor protein  32.69 
 
 
158 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0510178  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1952  PBP family phospholipid-binding protein  32.03 
 
 
179 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.028514  normal  0.707107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1308  putative kinase inhibitor protein  33.11 
 
 
160 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0110  PBP family phospholipid-binding protein  35.9 
 
 
180 aa  57.8  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1616  PBP family phospholipid-binding protein  30.97 
 
 
159 aa  57.8  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.160049  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1141  PEBP family protein  29.92 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.127497  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1700  PEBP family protein  30.67 
 
 
185 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3962  YbcL  29.17 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815606  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4082  PEBP family protein  27.74 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0921  putative kinase inhibitor protein  32.05 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.168155  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0133  PEBP family protein  27.81 
 
 
190 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0508261  normal  0.372147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>