52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4001 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3450  arylsulfate sulfotransferase  58.68 
 
 
598 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.921011 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3333  arylsulfate sulfotransferase  59.53 
 
 
598 aa  731    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3872  arylsulfate sulfotransferase  73.33 
 
 
596 aa  944    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4022  arylsulfotransferase  74.62 
 
 
596 aa  961    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3443  arylsulfate sulfotransferase  58.68 
 
 
598 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30935  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4001  arylsulfate sulfotransferase  100 
 
 
591 aa  1224    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0413696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3545  arylsulfate sulfotransferase  58.68 
 
 
598 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.949086 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3373  arylsulfate sulfotransferase  58.68 
 
 
598 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3378  arylsulfate sulfotransferase  58.68 
 
 
598 aa  712    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.953621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0237  arylsulfate sulfotransferase  45.21 
 
 
567 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0436  arylsulfotransferase  46.23 
 
 
602 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4027  arylsulfotransferase  45.68 
 
 
586 aa  484  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1752  arylsulfotransferase  43.82 
 
 
586 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00146407  hitchhiker  0.00673142 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0844  arylsulfotransferase  43.38 
 
 
590 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0901  fructose-bisphosphate aldolase  44.5 
 
 
588 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1149  arylsulfotransferase  43.25 
 
 
606 aa  457  1e-127  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4429  arylsulfotransferase  44.15 
 
 
565 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4344  arylsulfotransferase  43.8 
 
 
596 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4498  arylsulfotransferase  43.8 
 
 
596 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4314  arylsulfotransferase  43.8 
 
 
596 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.868472  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4430  arylsulfotransferase  43.63 
 
 
596 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1584  arylsulfotransferase  42.06 
 
 
601 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0560  arylsulfate sulfotransferase  41.9 
 
 
616 aa  414  1e-114  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0236  arylsulfotransferase  40.51 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0882  arylsulfate sulfotransferase, degenerate  42.16 
 
 
620 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08230  Arylsulfotransferase  41.72 
 
 
590 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5000  arylsulfotransferase  40.89 
 
 
558 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164429  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1436  Arylsulfotransferase  42.05 
 
 
625 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0759289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1382  arylsulfotransferase  41.52 
 
 
625 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.019077  normal  0.109845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4367  arylsulfotransferase  40.29 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4307  arylsulfotransferase  40.47 
 
 
607 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4211  arylsulfotransferase  40.29 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4188  arylsulfotransferase  40.29 
 
 
607 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4260  arylsulfotransferase  40.47 
 
 
607 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.790155  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0231  arylsulfotransferase  40.38 
 
 
611 aa  397  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3734  Arylsulfotransferase  28.23 
 
 
628 aa  120  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0171  Arylsulfotransferase  26.9 
 
 
626 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2404  Arylsulfotransferase  25.15 
 
 
1349 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0041  arylsulfotransferase  25.15 
 
 
571 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0042  arylsulfotransferase  25.35 
 
 
571 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.176316 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0043  arylsulfotransferase  25.15 
 
 
571 aa  92.4  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0043  arylsulfotransferase  24.32 
 
 
571 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0036  arylsulfotransferase  24.62 
 
 
572 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.719743  normal  0.23108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0037  arylsulfotransferase  24.42 
 
 
572 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0035  arylsulfotransferase  24.42 
 
 
572 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0785305 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0036  arylsulfotransferase  24.42 
 
 
572 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.453558  normal  0.16743 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1462  Arylsulfotransferase  21.29 
 
 
524 aa  50.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1825  Arylsulfotransferase  30.34 
 
 
502 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.56957e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1509  arylsulfotransferase  23.91 
 
 
584 aa  46.2  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.407507 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0371  hypothetical protein  22.64 
 
 
915 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000837445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08210  hypothetical protein  23.48 
 
 
450 aa  44.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1756  hypothetical protein  25.38 
 
 
614 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>