116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3481 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  100 
 
 		 393 aa  781    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  46.7 
 
 		 422 aa  349  5e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  46.05 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  44.56 
 
 		 395 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  44 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  40.91 
 
 		 417 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  39 
 
 		 420 aa  229  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  35.98 
 
 		 390 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  36.88 
 
 		 409 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 410 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  34.93 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 393 aa  206  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 409 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  36.97 
 
 		 425 aa  200  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 405 aa  196  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 409 aa  195  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 398 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  33.7 
 
 		 399 aa  190  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 423 aa  188  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  35.83 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 406 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 418 aa  185  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  33.79 
 
 		 426 aa  181  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 406 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 408 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  32.31 
 
 		 399 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  34.64 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  34.36 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 409 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  33.97 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 392 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 406 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 408 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  29.37 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 394 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  27.71 
 
 		 406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  29.19 
 
 		 392 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 420 aa  126  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  25.79 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  30.64 
 
 		 432 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  31.82 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  28 
 
 		 424 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 433 aa  90.5  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  27.53 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  28.93 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  30.48 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  28.62 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  28.57 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  28.62 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  28.57 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  29.33 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  28.23 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  27.24 
 
 		 424 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  25.4 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  31.79 
 
 		 314 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  29.11 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 441 aa  56.6  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3368  L-fucose transporter  23.32 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 469 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3437  L-fucose transporter  30.16 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.41 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.41 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5715  L-fucose transporter  25.99 
 
 		 417 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.988636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3348  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.35 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.241483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>