102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4866 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  817    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  75 
 
 		 423 aa  547  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  71.92 
 
 		 392 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  66.92 
 
 		 393 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  64.32 
 
 		 426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  64.16 
 
 		 399 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  61.48 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 		 397 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  39.61 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  37.08 
 
 		 390 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 409 aa  243  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 413 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 408 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 415 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  41.39 
 
 		 420 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 		 397 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  39.07 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  37.65 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  38.88 
 
 		 405 aa  229  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  38.77 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  37.87 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  38.82 
 
 		 419 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  37.9 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 409 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 409 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 406 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 409 aa  216  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  36.69 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  36.7 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  39.52 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  38.2 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  36.83 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 393 aa  196  8.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 395 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  33.59 
 
 		 393 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  34.7 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  34.38 
 
 		 399 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  33.58 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  30.38 
 
 		 422 aa  165  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  32.91 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  34.83 
 
 		 389 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  31.43 
 
 		 392 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  29.61 
 
 		 406 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 403 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 403 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 394 aa  143  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 403 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  35.62 
 
 		 389 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  29.21 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 420 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  26.43 
 
 		 465 aa  96.3  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  31.11 
 
 		 436 aa  87.8  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  28.42 
 
 		 432 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  28.85 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  26.51 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  26.91 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  36.27 
 
 		 205 aa  67  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  25.75 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  27.65 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  27.94 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  28.88 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  27.41 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  26.37 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 433 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  30.14 
 
 		 314 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.02 
 
 		 489 aa  51.2  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1075  undecaprenyldiphospho-muramoylpentapeptide beta-N- acetylglucosaminyltransferase  82.14 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.904386  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3565  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  81.48 
 
 		 870 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3597  HpcH/HpaI aldolase  84.62 
 
 		 356 aa  46.6  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1604  FolC bifunctional protein  73.33 
 
 		 501 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1866  glycine dehydrogenase  60.53 
 
 		 1014 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276293  normal  0.279729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>