101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0792 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  815    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  84.1 
 
 
418 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  83.7 
 
 
418 aa  567  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  60.4 
 
 
402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 
397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  46.58 
 
 
420 aa  296  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  41.04 
 
 
405 aa  272  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  42.59 
 
 
398 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  41.34 
 
 
405 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  40.1 
 
 
406 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  40 
 
 
401 aa  264  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 
415 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  41.37 
 
 
408 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  38.78 
 
 
413 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  41.29 
 
 
425 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  40 
 
 
393 aa  248  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  42.64 
 
 
397 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  39.45 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  39.43 
 
 
409 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 
393 aa  245  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  37.7 
 
 
390 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 
393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  38.72 
 
 
426 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
409 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  37.73 
 
 
408 aa  239  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  38.54 
 
 
423 aa  238  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 
410 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  37.7 
 
 
408 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  37.11 
 
 
375 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  39.19 
 
 
406 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  37.69 
 
 
408 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  37.21 
 
 
409 aa  226  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  41.53 
 
 
402 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  37.75 
 
 
409 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  35.9 
 
 
408 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  36.34 
 
 
409 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  37.02 
 
 
419 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  36.55 
 
 
406 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  37.05 
 
 
409 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  36.03 
 
 
406 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  35.77 
 
 
406 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  34.75 
 
 
396 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  34.69 
 
 
395 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  34.99 
 
 
393 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  38.08 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  34.95 
 
 
399 aa  199  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  34.77 
 
 
398 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  32.89 
 
 
422 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  36.01 
 
 
399 aa  189  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  36.72 
 
 
417 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  36.98 
 
 
412 aa  186  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  41.21 
 
 
389 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  31.42 
 
 
406 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  34.07 
 
 
403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  34.73 
 
 
403 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 
403 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  38.74 
 
 
389 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  33.87 
 
 
398 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  31.37 
 
 
392 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 
390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
394 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 
420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
444 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
420 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  24.51 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  29.25 
 
 
426 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  35.28 
 
 
374 aa  76.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  27.19 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  26.76 
 
 
428 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
420 aa  67  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  28.1 
 
 
395 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 
427 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  27.41 
 
 
424 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  28.42 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  26.85 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  24.93 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  26.85 
 
 
421 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  28.99 
 
 
436 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  24.93 
 
 
424 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  27.11 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  26.6 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  30.12 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  24.02 
 
 
422 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
402 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  29.59 
 
 
205 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  34.19 
 
 
409 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
423 aa  46.6  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 
494 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 
422 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 
441 aa  43.5  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  34.78 
 
 
408 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  26.02 
 
 
410 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>