96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0700 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 409 aa  805    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  75.43 
 
 		 406 aa  623  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  74.33 
 
 		 415 aa  615  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  76 
 
 		 413 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  69.7 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  61.52 
 
 		 410 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  59.74 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  56.31 
 
 		 409 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  57.98 
 
 		 409 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  50.13 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  52.66 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 398 aa  318  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  43.8 
 
 		 409 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 401 aa  308  8e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  44.67 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  44.62 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 406 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  43.64 
 
 		 408 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  41.07 
 
 		 405 aa  292  9e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  42.05 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  43.31 
 
 		 406 aa  289  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  41.73 
 
 		 408 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 409 aa  276  7e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 409 aa  275  9e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  43.41 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 397 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  41.51 
 
 		 420 aa  252  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 408 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 392 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 423 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  39.39 
 
 		 399 aa  236  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  36.39 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 397 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  38.52 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  34.7 
 
 		 422 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  37.06 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  38.01 
 
 		 426 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  36.2 
 
 		 402 aa  218  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  35.71 
 
 		 375 aa  216  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  38.31 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  37.91 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  36.55 
 
 		 412 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 398 aa  200  3e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  35.83 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 390 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  31.33 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  31.15 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  31.27 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 394 aa  146  6e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  33.71 
 
 		 389 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  34.77 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  28.3 
 
 		 465 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  28.98 
 
 		 432 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  27.11 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  25.59 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  26.6 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  25.32 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  26.82 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  25.48 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  25.06 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  26.49 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  35.96 
 
 		 205 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  25 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 420 aa  59.7  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 427 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  26.9 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  28 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  28.57 
 
 		 314 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 507 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  22.29 
 
 		 503 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  27.41 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  24.16 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4936  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.71 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>