103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0186 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  100 
 
 		 423 aa  832    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  79.42 
 
 		 392 aa  562  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  73.3 
 
 		 393 aa  535  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  68.93 
 
 		 426 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  76.62 
 
 		 416 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  67.27 
 
 		 399 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  63.11 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  43.44 
 
 		 406 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  39.56 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 397 aa  259  8e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  40.77 
 
 		 409 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  43.44 
 
 		 413 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  39.9 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  41.13 
 
 		 420 aa  249  9e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 		 410 aa  249  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  42.93 
 
 		 397 aa  242  9e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 418 aa  236  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  40.16 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  38.01 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 406 aa  234  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  38.4 
 
 		 375 aa  234  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 405 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 409 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  37.79 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  42.23 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  42.23 
 
 		 425 aa  229  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  40.73 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  38.92 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  40.7 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  38.56 
 
 		 402 aa  219  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  39.53 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  36.46 
 
 		 393 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 395 aa  205  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 393 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 412 aa  203  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  38.3 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 398 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  35.04 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  31.1 
 
 		 422 aa  173  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  32.51 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  31.13 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  34.94 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  35.51 
 
 		 389 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 394 aa  140  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  29.02 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 420 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  27.27 
 
 		 465 aa  94.4  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  28.87 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  27.76 
 
 		 432 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  28.07 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  28.07 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  29.89 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  28.95 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  28.65 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  28.65 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  27.2 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  27.78 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 422 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  28.05 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  29.21 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  34.31 
 
 		 205 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 427 aa  53.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  31.51 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8150  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  24.91 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.6 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>