More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1731 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  870    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  55.11 
 
 		 420 aa  418  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  30.1 
 
 		 428 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  27.9 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  28.5 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  28.5 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  28.75 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  28.5 
 
 		 421 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  28.95 
 
 		 424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  31.44 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  28.69 
 
 		 424 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  27.23 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 427 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 435 aa  97.8  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 393 aa  97.1  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  29.18 
 
 		 436 aa  96.7  7e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 409 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  29.53 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 433 aa  90.5  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  27.58 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 398 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  28.13 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  29.7 
 
 		 409 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 401 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 415 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  23.97 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  26.51 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  28.19 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  24.05 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  24.66 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  25.7 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  26.55 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  26.35 
 
 		 399 aa  67  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  23.63 
 
 		 422 aa  67  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  24.86 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  24.32 
 
 		 425 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  25 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  30.33 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.28 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.51 
 
 		 540 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  37.23 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.1 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03594  multidrug efflux system protein  27.74 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4219  multidrug efflux system protein MdtL  27.74 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  30 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.85 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4284  multidrug efflux system protein MdtL  27.74 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3944  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4212  multidrug efflux system protein MdtL  27.74 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3924  multidrug efflux system protein MdtL  27.74 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03538  hypothetical protein  27.74 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4257  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  24.48 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5141  multidrug efflux system protein MdtL  27.74 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2737  hypothetical protein  28.26 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.6 
 
 		 486 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1387  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4077  multidrug efflux system protein MdtL  27.74 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>