127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4451 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  100 
 
 
398 aa  785    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  68.12 
 
 
409 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  64.43 
 
 
393 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  62.76 
 
 
401 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  59.95 
 
 
408 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  61.44 
 
 
425 aa  418  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  61.48 
 
 
401 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  51.13 
 
 
405 aa  368  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  45.43 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 
415 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  48.65 
 
 
406 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  48.52 
 
 
410 aa  323  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  47.55 
 
 
408 aa  322  6e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  47.99 
 
 
419 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  43.99 
 
 
409 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  45.31 
 
 
409 aa  317  3e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  44.92 
 
 
413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  46.42 
 
 
409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  44.67 
 
 
408 aa  293  4e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  43.17 
 
 
406 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  42.93 
 
 
406 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  42.45 
 
 
409 aa  289  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  43.67 
 
 
408 aa  288  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  40.31 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  42.68 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  40.96 
 
 
399 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  43.04 
 
 
406 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
397 aa  276  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  41.62 
 
 
405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  44.62 
 
 
418 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  43.86 
 
 
408 aa  266  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 
397 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  42.9 
 
 
399 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  38.22 
 
 
395 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  41.71 
 
 
420 aa  263  3e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  44.11 
 
 
418 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  41.98 
 
 
419 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  36.99 
 
 
390 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  35.96 
 
 
396 aa  249  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  40.38 
 
 
393 aa  247  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  39.62 
 
 
393 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  37.53 
 
 
398 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  40.31 
 
 
402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  35.98 
 
 
422 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  37.5 
 
 
399 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  37.21 
 
 
412 aa  229  8e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  35.39 
 
 
375 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  38.8 
 
 
417 aa  228  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 
392 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  38.65 
 
 
423 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  36.89 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  40.05 
 
 
402 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  32.99 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  37.66 
 
 
416 aa  189  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  32.53 
 
 
398 aa  170  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  39.28 
 
 
389 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
390 aa  162  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  30.65 
 
 
406 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  31.37 
 
 
403 aa  156  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  38.44 
 
 
389 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  29.16 
 
 
392 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  31.1 
 
 
403 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
403 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
394 aa  135  9e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
420 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 
433 aa  112  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  30.3 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  30.54 
 
 
409 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  30.54 
 
 
421 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  31.77 
 
 
422 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  31.68 
 
 
421 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  32.49 
 
 
424 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  32.49 
 
 
424 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  30.3 
 
 
421 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  28.57 
 
 
432 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
420 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
444 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
427 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  30.03 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  27.14 
 
 
435 aa  90.1  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  23.89 
 
 
465 aa  88.6  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
426 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  29.53 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  32.28 
 
 
314 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 
444 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
427 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  27.66 
 
 
428 aa  72.8  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  30.35 
 
 
421 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
420 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  31.37 
 
 
374 aa  58.9  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  33.66 
 
 
205 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 
422 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1035  major facilitator transporter  28.31 
 
 
456 aa  49.7  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.46638  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0216  transport transmembrane protein  26.86 
 
 
409 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3306  efflux PumP antibiotic resistance protein  26.17 
 
 
492 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.403535  normal  0.0962569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4889  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.92 
 
 
419 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.84 
 
 
488 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>