115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1914 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
433 aa  786    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  47.41 
 
 
435 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  48.09 
 
 
433 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 
423 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  44.06 
 
 
444 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  42.78 
 
 
426 aa  230  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 
427 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  43.31 
 
 
426 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  41.92 
 
 
428 aa  218  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  47.93 
 
 
427 aa  216  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 
420 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  44.66 
 
 
441 aa  207  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  44.61 
 
 
402 aa  196  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  35.46 
 
 
424 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  42.97 
 
 
421 aa  182  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  40.82 
 
 
432 aa  176  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  37.37 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  35.55 
 
 
421 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  35.34 
 
 
409 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  35.7 
 
 
422 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  36.52 
 
 
421 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  35.04 
 
 
424 aa  167  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  35.04 
 
 
424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1387  major facilitator transporter  40.32 
 
 
448 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1423  major facilitator transporter  37.92 
 
 
491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.992292  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  35.15 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  36.82 
 
 
314 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  30.62 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  29.83 
 
 
393 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
397 aa  103  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  30.66 
 
 
393 aa  103  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 
420 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  28.66 
 
 
375 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  32.17 
 
 
408 aa  100  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  29.43 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  28 
 
 
396 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 
393 aa  99  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  30.25 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  29.01 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  26.63 
 
 
409 aa  96.7  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
397 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  29.62 
 
 
390 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  29.95 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  28.18 
 
 
403 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  29.12 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  26.01 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  30.1 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
409 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 
403 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  29.9 
 
 
406 aa  90.1  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  28.48 
 
 
403 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  29.08 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  28.66 
 
 
392 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  29.08 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  27.12 
 
 
409 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  29.21 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  29.33 
 
 
406 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 
410 aa  87  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  27.81 
 
 
398 aa  87  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  27.75 
 
 
395 aa  87  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  29.54 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  27.27 
 
 
412 aa  84  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  27.43 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  29.14 
 
 
408 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  30.68 
 
 
409 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  29.08 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  29.26 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  30.06 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  29.1 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  28.9 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 
401 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  30.79 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  28.46 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  26.69 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  31.01 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  29.76 
 
 
398 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  31.34 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  28.46 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  29.07 
 
 
418 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  27.45 
 
 
399 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
392 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 
418 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  28.52 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  28.14 
 
 
402 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
394 aa  57.4  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  25.13 
 
 
488 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  30.07 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  31.62 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.06 
 
 
515 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.97 
 
 
545 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0919  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  30.87 
 
 
389 aa  47.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.339104  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1058  major facilitator transporter  31.58 
 
 
471 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>