99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1694 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  100 
 
 
408 aa  800    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  70.62 
 
 
409 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  67.76 
 
 
406 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  67.76 
 
 
406 aa  520  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  66.83 
 
 
406 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  64.94 
 
 
409 aa  507  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  61.4 
 
 
408 aa  451  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  42.63 
 
 
406 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  43.64 
 
 
409 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 
415 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  43.67 
 
 
398 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  40.74 
 
 
413 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  42.09 
 
 
393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  43.99 
 
 
401 aa  272  9e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 
410 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  40.81 
 
 
419 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  43.26 
 
 
408 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 
401 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  44.3 
 
 
425 aa  263  6e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  42.36 
 
 
405 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  42.27 
 
 
408 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  43.48 
 
 
409 aa  256  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  41.32 
 
 
406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  40.65 
 
 
409 aa  252  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 
397 aa  252  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  40.39 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 
393 aa  243  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  40.62 
 
 
420 aa  242  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  41.39 
 
 
397 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  42.32 
 
 
408 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 
397 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  36.92 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  36.96 
 
 
399 aa  227  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  37.87 
 
 
399 aa  225  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 
392 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  38.1 
 
 
393 aa  224  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  37.79 
 
 
423 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  36.6 
 
 
390 aa  224  3e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  36.54 
 
 
426 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  35.32 
 
 
419 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  35.98 
 
 
395 aa  212  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  35.75 
 
 
412 aa  210  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  35.6 
 
 
375 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 
418 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  33.94 
 
 
396 aa  204  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  35 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  35.7 
 
 
402 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  34.99 
 
 
398 aa  196  6e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  38.08 
 
 
402 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  36.98 
 
 
416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  29.37 
 
 
393 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  34.34 
 
 
417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
394 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
390 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  31.85 
 
 
398 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  37.71 
 
 
389 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  28.04 
 
 
422 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  37.19 
 
 
389 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  30.41 
 
 
406 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  29.05 
 
 
392 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  29.72 
 
 
403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
403 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  29.92 
 
 
403 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  26.67 
 
 
465 aa  116  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
420 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  28.8 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
433 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  32.56 
 
 
426 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
420 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  27.66 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  29.84 
 
 
436 aa  77.4  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  27.97 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  27.8 
 
 
422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  27.83 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  30.68 
 
 
421 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  27.07 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  27.02 
 
 
421 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  27.24 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  27.24 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 
423 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  26.9 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
441 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  27.03 
 
 
435 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 
427 aa  67  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  27.37 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
420 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  36.45 
 
 
205 aa  62  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  29.73 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  30.32 
 
 
314 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
402 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1514  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
393 aa  44.3  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_49086  MFS family transporter: sugar (sialic acid)  29.84 
 
 
506 aa  43.1  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0133076  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>