107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2887 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  764    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  60.24 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  51.12 
 
 		 433 aa  303  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 		 444 aa  256  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  46.55 
 
 		 426 aa  248  1e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  42.89 
 
 		 428 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  52.56 
 
 		 433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  43.92 
 
 		 426 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  50.75 
 
 		 441 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 		 427 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  46.45 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  35.82 
 
 		 424 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  40.53 
 
 		 432 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 402 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  37.66 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  37.66 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  37.15 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  37.66 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  36.9 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  36.9 
 
 		 424 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 422 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  38.8 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1387  major facilitator transporter  46.37 
 
 		 448 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 420 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  38.95 
 
 		 314 aa  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1423  major facilitator transporter  44.64 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.992292  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 		 444 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 398 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 405 aa  95.5  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  25.74 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  26.49 
 
 		 393 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  29.21 
 
 		 406 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  29.4 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 397 aa  87.4  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 393 aa  86.7  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  25.61 
 
 		 390 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  28.21 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  27.8 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  31.56 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  28.05 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  25.9 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 403 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  25.63 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  25 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  25.94 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  27.71 
 
 		 399 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 395 aa  65.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  29.26 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  28.48 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  29.19 
 
 		 398 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  32.35 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 396 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  28.39 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  30.95 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1689  metabolite transport protein, N-terminus  34.72 
 
 		 114 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  31.25 
 
 		 425 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  23.41 
 
 		 399 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  29.76 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 		 483 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>