118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1416 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 402 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  46.85 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  43.97 
 
 		 433 aa  242  7.999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 420 aa  239  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  43.08 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  49.12 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  36.52 
 
 		 424 aa  209  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  37.03 
 
 		 409 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 		 423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  39.45 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  41.96 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  37.16 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  37.03 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  36.78 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  37.01 
 
 		 424 aa  189  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  40.76 
 
 		 432 aa  184  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  36.75 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1387  major facilitator transporter  44.71 
 
 		 448 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 420 aa  176  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 441 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1423  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 491 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.992292  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  44.1 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  36.78 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  38.49 
 
 		 314 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 444 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 410 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  31.97 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 405 aa  99.8  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 409 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 409 aa  97.1  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 393 aa  96.7  7e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 395 aa  95.5  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 393 aa  95.1  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 419 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 393 aa  93.2  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 398 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 401 aa  92.8  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  29.24 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 409 aa  84.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  25.41 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  26.7 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  28.06 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  27.05 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  26.59 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  26.92 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  23.99 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  26.7 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  27.34 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  23.96 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  28.87 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  26.52 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  26.69 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  28 
 
 		 417 aa  67  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  29.18 
 
 		 392 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  24.08 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 415 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 390 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  35.06 
 
 		 486 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 416 aa  50.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 381 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0143  hypothetical protein  40.48 
 
 		 156 aa  48.5  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1689  metabolite transport protein, N-terminus  32.39 
 
 		 114 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  24.46 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>