88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2007 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
398 aa  792    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  46.54 
 
 
406 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  46.4 
 
 
403 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  47.06 
 
 
392 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 
403 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  46.68 
 
 
403 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
397 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  34.56 
 
 
405 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  33.24 
 
 
390 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  36.13 
 
 
420 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  30.85 
 
 
415 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  33.33 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  31.82 
 
 
406 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  31.82 
 
 
413 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  33.87 
 
 
398 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  33.51 
 
 
408 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  32.67 
 
 
409 aa  170  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  35.48 
 
 
397 aa  170  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  33.6 
 
 
401 aa  168  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  35.33 
 
 
401 aa  163  6e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  31.51 
 
 
409 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
409 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  35.05 
 
 
425 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  30.23 
 
 
395 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  32.56 
 
 
409 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  30.56 
 
 
398 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 
410 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  30.49 
 
 
399 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  35 
 
 
409 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  31.72 
 
 
419 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  31.44 
 
 
408 aa  157  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  32.82 
 
 
402 aa  156  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
393 aa  156  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  30.96 
 
 
406 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  30.96 
 
 
406 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  30.77 
 
 
405 aa  155  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  34.14 
 
 
408 aa  155  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  34.17 
 
 
393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  32.31 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  29.04 
 
 
396 aa  152  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  31.73 
 
 
406 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  31.36 
 
 
426 aa  152  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  33.96 
 
 
419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  31.25 
 
 
406 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  31.61 
 
 
402 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  31.11 
 
 
412 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  32.06 
 
 
399 aa  143  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  28.17 
 
 
408 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
393 aa  136  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  32.7 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
392 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  28.25 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  29.61 
 
 
399 aa  126  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  32.18 
 
 
417 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  25.79 
 
 
393 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  28.38 
 
 
422 aa  120  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  32.07 
 
 
389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  28.57 
 
 
423 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  31.97 
 
 
389 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  30.45 
 
 
416 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
420 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 
420 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
394 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  23.61 
 
 
465 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  25.74 
 
 
428 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  24.73 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  24.56 
 
 
432 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  27.51 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 
441 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
444 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
426 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
422 aa  47.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 
433 aa  47  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1653  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
392 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0146262  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  30.54 
 
 
409 aa  45.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
427 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  24.68 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  27.64 
 
 
421 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  31.62 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  25.93 
 
 
395 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>