95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0823 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  799    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  62.93 
 
 		 408 aa  488  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  53.92 
 
 		 405 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 398 aa  285  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  45.96 
 
 		 408 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  39.65 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  43.13 
 
 		 410 aa  269  8e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 406 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  40.78 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 413 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 419 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  43.15 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  39.14 
 
 		 409 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  41.97 
 
 		 409 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  42.64 
 
 		 425 aa  246  6.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  40.61 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 409 aa  233  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  41.49 
 
 		 408 aa  232  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 409 aa  231  1e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  39.79 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  39.79 
 
 		 406 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  37.77 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 405 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 419 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  35.5 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  38.24 
 
 		 399 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 406 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  38.15 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  37.31 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 396 aa  203  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  35.03 
 
 		 375 aa  203  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 397 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 418 aa  190  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  36.63 
 
 		 426 aa  186  6e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  36.24 
 
 		 399 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  34.73 
 
 		 412 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 402 aa  173  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  32.05 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 402 aa  169  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  31.61 
 
 		 393 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  34.91 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  28.25 
 
 		 398 aa  129  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  28.32 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  29.89 
 
 		 392 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 403 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  31.18 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  31.32 
 
 		 426 aa  89  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  31.74 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  31.5 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 435 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  26.73 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  25 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  26.52 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  27.3 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  26.64 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  26.97 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  27.12 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  27.12 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  26.8 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 422 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  26.94 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  28.71 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 441 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 374 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  28.71 
 
 		 205 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>