77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49343 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  100 
 
 		 465 aa  932    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  27.05 
 
 		 408 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  28.15 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  26.7 
 
 		 406 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 393 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  25.74 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 402 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  25.65 
 
 		 375 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  25.31 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  24.18 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 401 aa  93.2  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 410 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  25.22 
 
 		 409 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  25.24 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  27.44 
 
 		 399 aa  91.7  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  26.22 
 
 		 426 aa  90.5  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  24.09 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 395 aa  87.8  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  26.83 
 
 		 399 aa  87  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  25.4 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  26.25 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  26.86 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  23.61 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  25.29 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  22.9 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  21.41 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  21.75 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 422 aa  57  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  24.15 
 
 		 424 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  25.17 
 
 		 424 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  25.17 
 
 		 424 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 420 aa  50.1  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  24.72 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  24.4 
 
 		 421 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  24.05 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  23.37 
 
 		 421 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>