100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1531 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  86.52 
 
 		 410 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  810    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  75.19 
 
 		 409 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  77.87 
 
 		 409 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  57.74 
 
 		 406 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  57.22 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  61.97 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  59.74 
 
 		 409 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  59.34 
 
 		 413 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  62.71 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  59.74 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 409 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 401 aa  317  3e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  48.97 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  50.52 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  50.52 
 
 		 425 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 405 aa  305  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 408 aa  280  5e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  44.66 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  44.17 
 
 		 406 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 409 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  41.6 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 393 aa  265  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 408 aa  265  2e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  42.09 
 
 		 408 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  40.61 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  40.92 
 
 		 420 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  41.53 
 
 		 399 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 		 397 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  42.45 
 
 		 423 aa  237  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  40.57 
 
 		 397 aa  236  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  38.73 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 395 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  35.31 
 
 		 422 aa  218  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  35.85 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 393 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  38.4 
 
 		 393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 418 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 396 aa  210  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  34.43 
 
 		 375 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  37.15 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  37.28 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  37.28 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  39.27 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  32.26 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  31.56 
 
 		 406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  35.03 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 403 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  30.53 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  34.46 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  29.57 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  26.61 
 
 		 465 aa  86.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 		 420 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  27.56 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  27.12 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  27.4 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  27.4 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  27.14 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  30.46 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  27.71 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  27.08 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  28.47 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  31.12 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  34 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 374 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  28.02 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1045  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.18 
 
 		 461 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 441 aa  47  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1629  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.09 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6097  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>