100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3779 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  100 
 
 		 435 aa  822    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  62.44 
 
 		 423 aa  353  2.9999999999999997e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  50.12 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  51.7 
 
 		 441 aa  279  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 		 444 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 427 aa  272  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  44.96 
 
 		 428 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  49.18 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  42.16 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  47.5 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  44.01 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  40.94 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  38.59 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 421 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  36.52 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  36.96 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  37.2 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  36.14 
 
 		 421 aa  196  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1387  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 448 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  36.48 
 
 		 409 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  36.14 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  35.89 
 
 		 421 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1423  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.992292  normal  0.119339 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  37.35 
 
 		 436 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 420 aa  167  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  36.39 
 
 		 314 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 444 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  27.05 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 398 aa  98.2  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 408 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 415 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 409 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  28.03 
 
 		 406 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  26.27 
 
 		 393 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  25.66 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 403 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 413 aa  86.7  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  28.69 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  25.07 
 
 		 375 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  27.05 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  26.49 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  28.41 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 409 aa  77.4  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  25.62 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  26.3 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  25.62 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  28.74 
 
 		 398 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  25.78 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  25.56 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  26.46 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 394 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1689  metabolite transport protein, N-terminus  37.33 
 
 		 114 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  25.91 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  34.96 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 402 aa  51.6  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0143  hypothetical protein  41.54 
 
 		 156 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 407 aa  47.4  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  28.78 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00233  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14500)  30.43 
 
 		 503 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 461 aa  43.5  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>