More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1604 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1604  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 501 aa  1021    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  74.3 
 
 		 453 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  61.18 
 
 		 441 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  60.98 
 
 		 441 aa  581  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  61.87 
 
 		 440 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  59.63 
 
 		 441 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  60.32 
 
 		 435 aa  538  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  58.66 
 
 		 441 aa  530  1e-149  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  57.26 
 
 		 441 aa  521  1e-146  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  55.91 
 
 		 440 aa  513  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  56.88 
 
 		 437 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  52.92 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  52.92 
 
 		 437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  51.67 
 
 		 436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  52.71 
 
 		 461 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  52.71 
 
 		 437 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  52.71 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  52.71 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  52.71 
 
 		 461 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  52.71 
 
 		 461 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  48.23 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  48.58 
 
 		 411 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  48.96 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  49.05 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  47.52 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  47.31 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  48.75 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  47.31 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  47.31 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  47.52 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  47.31 
 
 		 436 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  47.11 
 
 		 436 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  47.52 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  45.66 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  43.67 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  44.63 
 
 		 436 aa  354  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  42.11 
 
 		 432 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  43.76 
 
 		 422 aa  325  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  42.77 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2133  FolC bifunctional protein  61.42 
 
 		 432 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1809  FolC bifunctional protein  61.42 
 
 		 432 aa  317  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  62.61 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  38.12 
 
 		 416 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  37.92 
 
 		 416 aa  299  8e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  39.01 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  36.58 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  36.36 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  39.45 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  45.99 
 
 		 386 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  36.67 
 
 		 443 aa  276  4e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  39.05 
 
 		 432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  37.37 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  40.3 
 
 		 422 aa  263  4.999999999999999e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  57.33 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  39.51 
 
 		 437 aa  256  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.66 
 
 		 422 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  55.65 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.43 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.43 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.43 
 
 		 434 aa  251  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  56.9 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  38.45 
 
 		 422 aa  250  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.52 
 
 		 422 aa  249  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  54.04 
 
 		 421 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.52 
 
 		 422 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.52 
 
 		 422 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.52 
 
 		 422 aa  249  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  54.43 
 
 		 432 aa  249  1e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.52 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  56.52 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.52 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  57.83 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  56.52 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.52 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  54.43 
 
 		 432 aa  247  3e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  54.7 
 
 		 425 aa  247  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  54.13 
 
 		 422 aa  247  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  57.39 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.78 
 
 		 443 aa  246  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.96 
 
 		 422 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  38.08 
 
 		 432 aa  244  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  54.55 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  53.97 
 
 		 429 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  52.14 
 
 		 432 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  53.16 
 
 		 421 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  52.14 
 
 		 432 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  51.28 
 
 		 431 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02507  folylpolyglutamate synthase; dihydrofolate synthase  53.04 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  37.34 
 
 		 421 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  51.28 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  51.28 
 
 		 423 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  51.28 
 
 		 423 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  51.88 
 
 		 429 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  51.28 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0758  FolC bifunctional protein  34.76 
 
 		 451 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000171219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  54.13 
 
 		 422 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  49.37 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  51.46 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  54.01 
 
 		 434 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  54.43 
 
 		 434 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>