More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2607 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  86.73 
 
 
422 aa  725    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  86.73 
 
 
422 aa  725    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  99.53 
 
 
422 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  86.73 
 
 
422 aa  725    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  86.49 
 
 
422 aa  727    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  86.73 
 
 
422 aa  725    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  86.73 
 
 
422 aa  726    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  86.73 
 
 
422 aa  726    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  100 
 
 
422 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  99.29 
 
 
422 aa  851    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  99.29 
 
 
422 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  86.26 
 
 
422 aa  723    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  99.29 
 
 
422 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  86.73 
 
 
422 aa  726    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  81.52 
 
 
422 aa  699    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.48 
 
 
422 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.96 
 
 
422 aa  585  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.43 
 
 
422 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  65.66 
 
 
434 aa  564  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  65.66 
 
 
434 aa  564  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  65.43 
 
 
434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  67.79 
 
 
420 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.48 
 
 
422 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  54.83 
 
 
421 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  50.85 
 
 
420 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0366  dihydrofolate:folylpolyglutamate synthetase  53.01 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  51.51 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  49.76 
 
 
448 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  51.72 
 
 
432 aa  411  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  51.72 
 
 
432 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  49.76 
 
 
426 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  51.23 
 
 
432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  51.48 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  51.94 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  50.49 
 
 
431 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  50.99 
 
 
423 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  50.99 
 
 
423 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  51.23 
 
 
423 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  51.23 
 
 
423 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  48.17 
 
 
443 aa  389  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  47.33 
 
 
430 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  47.72 
 
 
421 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  47.48 
 
 
425 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  48.66 
 
 
421 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  43.94 
 
 
428 aa  363  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  48.3 
 
 
432 aa  355  7.999999999999999e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  48.59 
 
 
448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  48.29 
 
 
421 aa  353  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  43.27 
 
 
416 aa  350  3e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  43.03 
 
 
416 aa  348  8e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  44 
 
 
426 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.99 
 
 
434 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  46 
 
 
418 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.41 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  47.61 
 
 
453 aa  342  5e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  46.88 
 
 
434 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  46.21 
 
 
441 aa  338  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  46.21 
 
 
441 aa  338  9e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  47.13 
 
 
422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  45.89 
 
 
425 aa  336  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  49.03 
 
 
428 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  47.39 
 
 
441 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  45.61 
 
 
440 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  46.86 
 
 
435 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  45.92 
 
 
435 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  45.69 
 
 
436 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  42.56 
 
 
442 aa  328  8e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  45.41 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  42.86 
 
 
441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  42.96 
 
 
437 aa  327  3e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  44.72 
 
 
437 aa  326  5e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  45.63 
 
 
436 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  48.31 
 
 
433 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  45.63 
 
 
436 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  47.1 
 
 
429 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  46.65 
 
 
441 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  44.92 
 
 
436 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  44.55 
 
 
432 aa  323  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  44.92 
 
 
436 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  46.21 
 
 
437 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  44.92 
 
 
436 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  54.19 
 
 
386 aa  322  5e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  44.34 
 
 
432 aa  322  6e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  45.15 
 
 
436 aa  322  7e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  44.68 
 
 
436 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  45.45 
 
 
435 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  44.34 
 
 
432 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  44.68 
 
 
436 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  45.28 
 
 
423 aa  317  3e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.98 
 
 
443 aa  316  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  43.95 
 
 
436 aa  315  9e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  45.84 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  43.26 
 
 
436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  42.82 
 
 
411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  40.05 
 
 
428 aa  313  4.999999999999999e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  43.53 
 
 
441 aa  312  9e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  46.14 
 
 
429 aa  310  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02507  folylpolyglutamate synthase; dihydrofolate synthase  45.39 
 
 
432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  43.74 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.42 
 
 
437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>