More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1256 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  100 
 
 
386 aa  764    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  56.47 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  56.59 
 
 
420 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  56.47 
 
 
432 aa  324  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  54.84 
 
 
432 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  55.08 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  54.78 
 
 
422 aa  311  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.58 
 
 
422 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.8 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.8 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.26 
 
 
422 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.26 
 
 
422 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.26 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  54.66 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.5 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.26 
 
 
422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  51.57 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1239  FolC bifunctional protein  54.14 
 
 
437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.168236  normal  0.703163 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  55.56 
 
 
448 aa  306  6e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  47.3 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  50.8 
 
 
420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  51.61 
 
 
406 aa  302  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  53.75 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  53.89 
 
 
422 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  53.5 
 
 
437 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  50.62 
 
 
436 aa  300  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  53.65 
 
 
440 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.61 
 
 
422 aa  298  9e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  50.62 
 
 
436 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.61 
 
 
422 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  46.15 
 
 
416 aa  297  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  53.77 
 
 
422 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.28 
 
 
422 aa  296  4e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  51.09 
 
 
453 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.61 
 
 
422 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  51.61 
 
 
422 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  51.61 
 
 
422 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.61 
 
 
422 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.61 
 
 
422 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.61 
 
 
422 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  46.15 
 
 
416 aa  296  5e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  50.15 
 
 
421 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  52.35 
 
 
440 aa  295  9e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  52.35 
 
 
441 aa  295  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  52.35 
 
 
441 aa  295  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  51.29 
 
 
422 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  52.16 
 
 
436 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  52.47 
 
 
436 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  52.47 
 
 
436 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  50.94 
 
 
441 aa  292  7e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02507  folylpolyglutamate synthase; dihydrofolate synthase  54.31 
 
 
432 aa  291  9e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  52.73 
 
 
422 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  53.18 
 
 
432 aa  291  1e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  50.46 
 
 
425 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  50 
 
 
441 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  51.27 
 
 
442 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  53.33 
 
 
432 aa  290  4e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  51.99 
 
 
435 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  54.6 
 
 
423 aa  289  6e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  51.54 
 
 
436 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  51.54 
 
 
436 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  51.54 
 
 
436 aa  289  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  48.73 
 
 
423 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  48.46 
 
 
436 aa  288  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  45.78 
 
 
428 aa  288  1e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  52.27 
 
 
436 aa  287  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  51.23 
 
 
436 aa  287  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  52.02 
 
 
437 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  47.77 
 
 
432 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  47.77 
 
 
432 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  51.71 
 
 
437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  51.71 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  51.71 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  51.71 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  47.45 
 
 
432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  51.71 
 
 
437 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  51.71 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  51.71 
 
 
461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  48.4 
 
 
421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  49.07 
 
 
430 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  46.84 
 
 
448 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  45.29 
 
 
421 aa  282  9e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  45.86 
 
 
431 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  47.45 
 
 
423 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  47.45 
 
 
423 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  47.45 
 
 
423 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  47.45 
 
 
423 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  51.4 
 
 
436 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  51.09 
 
 
436 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  52.96 
 
 
432 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  51.89 
 
 
441 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2133  FolC bifunctional protein  51.07 
 
 
432 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  51.61 
 
 
411 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  45.34 
 
 
428 aa  277  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  46.47 
 
 
421 aa  277  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1264  FolC bifunctional protein  53.78 
 
 
437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  48.26 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  50.46 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  49.41 
 
 
434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  50.47 
 
 
434 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>