More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6838 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  84.17 
 
 
436 aa  749    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  77.57 
 
 
437 aa  666    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  77.57 
 
 
447 aa  667    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  84.17 
 
 
436 aa  745    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  77.57 
 
 
461 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  84.63 
 
 
436 aa  748    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  77.8 
 
 
437 aa  670    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  77.8 
 
 
437 aa  667    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  77.57 
 
 
455 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  95.87 
 
 
436 aa  863    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  84.63 
 
 
436 aa  748    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  100 
 
 
436 aa  893    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  77.57 
 
 
461 aa  667    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  82.8 
 
 
436 aa  730    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  82.8 
 
 
436 aa  730    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  84.63 
 
 
436 aa  748    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  88.99 
 
 
436 aa  791    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  77.57 
 
 
461 aa  667    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  69.12 
 
 
436 aa  618  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  68.58 
 
 
432 aa  614  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2133  FolC bifunctional protein  70.87 
 
 
432 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1809  FolC bifunctional protein  70.18 
 
 
432 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  69.12 
 
 
436 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  65.75 
 
 
441 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  65.54 
 
 
411 aa  553  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  57.54 
 
 
441 aa  498  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  57.81 
 
 
440 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  57.24 
 
 
453 aa  497  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  56.44 
 
 
441 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  57.27 
 
 
440 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  56.44 
 
 
441 aa  492  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  58.37 
 
 
437 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  56.95 
 
 
437 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  56.18 
 
 
441 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  56.54 
 
 
441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  55.61 
 
 
435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  56.16 
 
 
436 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  52.25 
 
 
442 aa  433  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1604  FolC bifunctional protein  48.35 
 
 
501 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  48.17 
 
 
422 aa  385  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.73 
 
 
431 aa  354  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  48.71 
 
 
448 aa  350  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  44.55 
 
 
432 aa  343  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  44.55 
 
 
448 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  44.11 
 
 
421 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  42.92 
 
 
428 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  43.4 
 
 
428 aa  330  3e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  45.92 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  42.35 
 
 
421 aa  325  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  43.24 
 
 
426 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  41.96 
 
 
432 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  43.84 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  42.86 
 
 
416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  44.44 
 
 
422 aa  320  3e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  44.52 
 
 
435 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  42.32 
 
 
421 aa  319  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  42.01 
 
 
430 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  42.38 
 
 
416 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  43.03 
 
 
425 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  43.79 
 
 
436 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  41.59 
 
 
423 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  41.16 
 
 
432 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  42.42 
 
 
423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  43.68 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  41.96 
 
 
421 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  41.16 
 
 
432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  42.42 
 
 
423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  42.42 
 
 
423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  42.18 
 
 
423 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  41.36 
 
 
431 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  43.05 
 
 
435 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  45.18 
 
 
434 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  42.59 
 
 
421 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  40.6 
 
 
420 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  40.28 
 
 
425 aa  310  4e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.5 
 
 
422 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  40.98 
 
 
406 aa  308  8e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.8 
 
 
434 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.26 
 
 
422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.26 
 
 
422 aa  306  3e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.47 
 
 
434 aa  306  6e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.03 
 
 
422 aa  305  8.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.47 
 
 
434 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.47 
 
 
434 aa  305  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.03 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.03 
 
 
422 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.4 
 
 
422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  45.43 
 
 
433 aa  302  9e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  44.04 
 
 
425 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1256  FolC bifunctional protein  50.62 
 
 
386 aa  300  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  44.47 
 
 
429 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  40.43 
 
 
422 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  44.57 
 
 
432 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  44.57 
 
 
423 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  44.57 
 
 
432 aa  294  2e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  43.39 
 
 
429 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  40.7 
 
 
443 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.74 
 
 
422 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1555  FolC bifunctional protein  43.4 
 
 
438 aa  290  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.282101  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.51 
 
 
422 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>