More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1468 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  74.17 
 
 
422 aa  656    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  100 
 
 
422 aa  865    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  93.6 
 
 
422 aa  789    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  72.69 
 
 
434 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  72.69 
 
 
434 aa  632  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  72.69 
 
 
434 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  75.36 
 
 
422 aa  610  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  74.34 
 
 
420 aa  607  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.43 
 
 
422 aa  596  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.9 
 
 
422 aa  588  1e-167  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.48 
 
 
422 aa  588  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.72 
 
 
422 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.72 
 
 
422 aa  591  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.66 
 
 
422 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  68.66 
 
 
422 aa  584  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  68.66 
 
 
422 aa  584  1e-166  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.9 
 
 
422 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.66 
 
 
422 aa  584  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.48 
 
 
422 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.9 
 
 
422 aa  586  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.48 
 
 
422 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.9 
 
 
422 aa  586  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  68.66 
 
 
422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  55.23 
 
 
421 aa  451  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0366  dihydrofolate:folylpolyglutamate synthetase  55.18 
 
 
426 aa  449  1e-125  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  52.21 
 
 
420 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  51.1 
 
 
432 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  50.98 
 
 
432 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  51.67 
 
 
426 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  50.86 
 
 
432 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  50.86 
 
 
423 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  51.26 
 
 
406 aa  412  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  49.76 
 
 
448 aa  408  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  50.61 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  52.29 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  50.61 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  49.27 
 
 
431 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 
423 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 
423 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  50.24 
 
 
421 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  48.53 
 
 
421 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  47.12 
 
 
421 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  47.23 
 
 
425 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  47.27 
 
 
430 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  45.61 
 
 
428 aa  365  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  47.09 
 
 
434 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  48.05 
 
 
421 aa  359  5e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  43.77 
 
 
416 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.5 
 
 
434 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  47.62 
 
 
432 aa  352  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  43.77 
 
 
416 aa  352  5e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  47.39 
 
 
425 aa  352  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  47.52 
 
 
436 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  44.63 
 
 
418 aa  350  3e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  47.38 
 
 
435 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  43.82 
 
 
426 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  45.22 
 
 
453 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  47.1 
 
 
422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  48.24 
 
 
435 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  45.21 
 
 
442 aa  343  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  46.23 
 
 
429 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  44.52 
 
 
441 aa  343  5e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  49.18 
 
 
433 aa  342  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  48.23 
 
 
435 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  45.73 
 
 
437 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  46.92 
 
 
448 aa  339  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.12 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  45.37 
 
 
443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  45.48 
 
 
441 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  46.12 
 
 
440 aa  334  2e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  46.41 
 
 
441 aa  333  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  46.93 
 
 
437 aa  333  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  45.01 
 
 
441 aa  333  4e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  45.54 
 
 
411 aa  332  8e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  47.62 
 
 
428 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  45.18 
 
 
441 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  43.23 
 
 
437 aa  330  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  45.86 
 
 
436 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  45.86 
 
 
436 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  47.13 
 
 
441 aa  329  6e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  44.71 
 
 
440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  45.28 
 
 
429 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  46.96 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  44.68 
 
 
436 aa  325  6e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  45.15 
 
 
436 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  45 
 
 
432 aa  324  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.88 
 
 
437 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  45.15 
 
 
436 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  44.8 
 
 
436 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  43.97 
 
 
436 aa  319  6e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  43.97 
 
 
436 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  43.97 
 
 
436 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  43.97 
 
 
436 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  43.39 
 
 
461 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  43.39 
 
 
437 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  43.39 
 
 
437 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  43.39 
 
 
461 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  43.39 
 
 
461 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.39 
 
 
447 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  43.39 
 
 
455 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>