More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2797 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  74.17 
 
 		 422 aa  655    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  93.6 
 
 		 422 aa  809    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  100 
 
 		 422 aa  863    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  72.45 
 
 		 434 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  72.45 
 
 		 434 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  72.45 
 
 		 434 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  75.12 
 
 		 422 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  74.58 
 
 		 420 aa  601  1.0000000000000001e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2864  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  70.38 
 
 		 422 aa  602  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.713895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.91 
 
 		 422 aa  599  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.91 
 
 		 422 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.67 
 
 		 422 aa  598  1e-170  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.67 
 
 		 422 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  69.67 
 
 		 422 aa  596  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.67 
 
 		 422 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.67 
 
 		 422 aa  595  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  69.67 
 
 		 422 aa  596  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.43 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.67 
 
 		 422 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.43 
 
 		 422 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.67 
 
 		 422 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.43 
 
 		 422 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  69.43 
 
 		 422 aa  590  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0366  dihydrofolate:folylpolyglutamate synthetase  55.18 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  55.39 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  52.08 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  52.08 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  51.95 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  52.33 
 
 		 420 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  52.01 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  51.67 
 
 		 426 aa  418  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  51.61 
 
 		 443 aa  411  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  50.61 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  49.51 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  49.76 
 
 		 448 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  50.61 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  50.61 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  50.12 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  49.63 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  50 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  47.93 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  47.12 
 
 		 421 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  47.03 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  47.23 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  47.32 
 
 		 434 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1968  FolC bifunctional protein  44.88 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.843796 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.73 
 
 		 434 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  47.87 
 
 		 425 aa  356  5e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1606  FolC bifunctional protein  44.29 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  43.77 
 
 		 416 aa  352  7e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  43.77 
 
 		 416 aa  351  2e-95  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  46.9 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  47.62 
 
 		 436 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  47.28 
 
 		 435 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  49.88 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  46.12 
 
 		 421 aa  343  2e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  48.48 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  47.34 
 
 		 422 aa  342  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  47.99 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  46.14 
 
 		 443 aa  342  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  44.65 
 
 		 441 aa  342  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  43.68 
 
 		 418 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  46.7 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  47.14 
 
 		 448 aa  339  7e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  45.22 
 
 		 453 aa  339  7e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  45.43 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.12 
 
 		 431 aa  335  9e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  46.35 
 
 		 440 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  46.89 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  47.38 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  45.96 
 
 		 437 aa  331  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  46.1 
 
 		 437 aa  328  7e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  45.65 
 
 		 429 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  46.73 
 
 		 441 aa  328  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  45.19 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  45.11 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  45.37 
 
 		 440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  44.87 
 
 		 441 aa  326  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  45.15 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  45.15 
 
 		 436 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  46.47 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3801  folC bifunctional protein  42.52 
 
 		 437 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  40.05 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  46.42 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  44.68 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  44.44 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.68 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  43.97 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  43.97 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  44.1 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  43.97 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  43.97 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  42.86 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  40.47 
 
 		 425 aa  312  5.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  44.34 
 
 		 432 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  43.97 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0809  FolC bifunctional protein  44.58 
 
 		 423 aa  308  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0844236 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  42.25 
 
 		 461 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  42.25 
 
 		 461 aa  308  8e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>