More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4378 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  76.64 
 
 
455 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  76.64 
 
 
437 aa  657    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  76.64 
 
 
461 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  76.87 
 
 
437 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  76.64 
 
 
447 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  82.11 
 
 
436 aa  734    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  81.88 
 
 
436 aa  730    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  88.99 
 
 
436 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  76.4 
 
 
437 aa  655    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  83.03 
 
 
436 aa  738    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  88.76 
 
 
436 aa  812    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  81.88 
 
 
436 aa  730    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  100 
 
 
436 aa  895    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  81.42 
 
 
436 aa  726    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  76.64 
 
 
461 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  81.88 
 
 
436 aa  730    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  81.42 
 
 
436 aa  726    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  76.64 
 
 
461 aa  658    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1809  FolC bifunctional protein  70.87 
 
 
432 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2133  FolC bifunctional protein  70.64 
 
 
432 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  67.97 
 
 
436 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  67.66 
 
 
432 aa  604  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  67.97 
 
 
436 aa  606  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  65.06 
 
 
441 aa  581  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  64.34 
 
 
411 aa  543  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  55.97 
 
 
441 aa  486  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  56.81 
 
 
440 aa  484  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  55.83 
 
 
440 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  55.74 
 
 
441 aa  483  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  56.38 
 
 
441 aa  480  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  56.74 
 
 
437 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  53.5 
 
 
453 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  55.81 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  55.14 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  54.31 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  55.94 
 
 
436 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  54.21 
 
 
435 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  51.58 
 
 
442 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  48.62 
 
 
422 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1604  FolC bifunctional protein  45.66 
 
 
501 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  49.88 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  45.67 
 
 
431 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  45.26 
 
 
432 aa  346  6e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  44.08 
 
 
448 aa  332  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  41.75 
 
 
428 aa  324  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  42.62 
 
 
416 aa  322  6e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  42.14 
 
 
416 aa  320  3.9999999999999996e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  41.78 
 
 
421 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  44.76 
 
 
432 aa  319  5e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  41.57 
 
 
421 aa  319  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  41.51 
 
 
428 aa  318  7.999999999999999e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  42.34 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  43.84 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  43.15 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  41.61 
 
 
421 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  41.96 
 
 
421 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.26 
 
 
422 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  42.82 
 
 
406 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  42.46 
 
 
420 aa  312  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  42.79 
 
 
436 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  41.29 
 
 
432 aa  312  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  42.59 
 
 
421 aa  310  4e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  44.27 
 
 
434 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  41.1 
 
 
430 aa  309  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0806  FolC bifunctional protein  39.81 
 
 
425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  42.56 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  41.94 
 
 
423 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  42.99 
 
 
428 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  41.94 
 
 
423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  41.71 
 
 
423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  41.12 
 
 
423 aa  306  6e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  41.47 
 
 
423 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  41.91 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.03 
 
 
422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  45.43 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  40.4 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.42 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  40.4 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.79 
 
 
422 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.79 
 
 
422 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.79 
 
 
422 aa  302  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  44.27 
 
 
425 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  40.47 
 
 
431 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.55 
 
 
422 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.55 
 
 
434 aa  298  9e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.55 
 
 
434 aa  298  1e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.55 
 
 
434 aa  298  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.61 
 
 
422 aa  297  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.08 
 
 
422 aa  298  2e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0880  folylpolyglutamate synthase  39.46 
 
 
443 aa  296  5e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0202612  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2045  FolC bifunctional protein  42.4 
 
 
418 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0860305  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23880  folylpolyglutamate synthetase  45.27 
 
 
429 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.351749  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.04 
 
 
422 aa  292  6e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1026  dihydrofolate synthase  42.96 
 
 
432 aa  293  6e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.170834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2022  folylpolyglutamate synthetase  44.99 
 
 
429 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.04 
 
 
422 aa  290  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.04 
 
 
422 aa  290  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0902  FolC bifunctional protein  42.73 
 
 
432 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  41.04 
 
 
422 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  40.09 
 
 
443 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>