More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1979 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1979  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  100 
 
 		 432 aa  880    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2302  folylpolyglutamate synthetase  75.69 
 
 		 436 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2133  FolC bifunctional protein  88.43 
 
 		 432 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.197533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1809  FolC bifunctional protein  87.96 
 
 		 432 aa  753    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2463  FolC bifunctional protein  74.08 
 
 		 436 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.399069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2877  folylpolyglutamate synthetase  68.81 
 
 		 436 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.971694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6838  FolC bifunctional protein  68.58 
 
 		 436 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.81174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4618  FolC bifunctional protein  69.5 
 
 		 436 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2121  folylpolyglutamate synthetase  69.04 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.700041  normal  0.055566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3566  FolC bifunctional protein  69.5 
 
 		 436 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4405  FolC bifunctional protein  69.5 
 
 		 436 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3962  FolC bifunctional protein  69.5 
 
 		 436 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4378  FolC bifunctional protein  67.66 
 
 		 436 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3857  FolC bifunctional protein  68.81 
 
 		 436 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3352  FolC bifunctional protein  68.81 
 
 		 436 aa  599  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.269104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0775  FolC bifunctional protein  65.66 
 
 		 441 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00183365  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0683  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  67.29 
 
 		 437 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.944672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1717  FolC bifunctional protein  66.36 
 
 		 437 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2303  FolC bifunctional protein  66.36 
 
 		 455 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.966782  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0765  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  66.36 
 
 		 447 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1862  FolC bifunctional protein  66.36 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.59484  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2441  FolC bifunctional protein  66.59 
 
 		 437 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.189653  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0533  FolC bifunctional protein  66.36 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1653  FolC bifunctional protein  66.36 
 
 		 461 aa  556  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1046  FolC bifunctional protein  64.72 
 
 		 411 aa  552  1e-156  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.777875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  60.05 
 
 		 440 aa  511  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2229  FolC bifunctional protein  59.95 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.369803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2739  FolC bifunctional protein  59.95 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  61.83 
 
 		 437 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  59.5 
 
 		 440 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1089  FolC bifunctional protein  59.91 
 
 		 453 aa  501  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.457474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1860  FolC bifunctional protein  59.25 
 
 		 441 aa  498  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.410312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2686  FolC bifunctional protein  59.14 
 
 		 441 aa  483  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.848421  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3374  FolC bifunctional protein  57.24 
 
 		 441 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348154  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3059  FolC bifunctional protein  58 
 
 		 437 aa  467  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.310579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3762  FolC bifunctional protein  57.48 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1909  FolC bifunctional protein  54.38 
 
 		 442 aa  441  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0873  folylpolyglutamate synthetase  52.73 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0218133 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1911  folylpolyglutamate synthetase  51.06 
 
 		 422 aa  386  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.553938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1604  FolC bifunctional protein  47.71 
 
 		 501 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1695  FolC bifunctional protein  49.17 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.382044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  47.99 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3265  cytoplasmic peptidoglycan synthetase C-terminal domain  48.14 
 
 		 448 aa  340  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.165848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.43 
 
 		 422 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1023  folylpolyglutamate synthetase  46.12 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1480  FolC bifunctional protein  45.22 
 
 		 432 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.293616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1396  FolC bifunctional protein  43.36 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1487  FolC bifunctional protein  44.13 
 
 		 448 aa  328  8e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152366  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1427  FolC bifunctional protein  44.63 
 
 		 432 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.361934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3067  FolC bifunctional protein  43.78 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1492  FolC bifunctional protein  44.5 
 
 		 432 aa  323  3e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.744207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1618  FolC bifunctional protein  44.15 
 
 		 421 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0841806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2835  FolC bifunctional protein  45.61 
 
 		 423 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.353544  hitchhiker  0.00994834 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1618  FolC bifunctional protein  45.61 
 
 		 423 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0522  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  43.5 
 
 		 421 aa  321  1.9999999999999998e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.250389  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1295  hypothetical protein  40.33 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2305  FolC bifunctional protein  44.13 
 
 		 430 aa  319  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.639794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2440  FolC bifunctional protein  44.63 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.715138  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2741  FolC bifunctional protein  45.37 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.778738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2758  FolC bifunctional protein  45.13 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.273906  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2983  FolC bifunctional protein  43.71 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00108921  normal  0.642049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1997  FolC bifunctional protein  45.31 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.708043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3764  FolC bifunctional protein  45.31 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1653  dihydrofolate synthase  41.9 
 
 		 421 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0133997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1558  FolC bifunctional protein  44.94 
 
 		 428 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.330747  normal  0.124911 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3331  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  44.76 
 
 		 420 aa  312  5.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0040495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  45.58 
 
 		 422 aa  312  5.999999999999999e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1531  FolC bifunctional protein  44.71 
 
 		 435 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.468548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  43.91 
 
 		 421 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.44 
 
 		 422 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002876  dihydrofolate synthase/folylpolyglutamate synthase  40.85 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.394624  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1665  folylpolyglutamate synthetase  46.59 
 
 		 434 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.157637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1532  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.41 
 
 		 434 aa  309  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182883  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1296  hypothetical protein  39.62 
 
 		 428 aa  308  9e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1423  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.41 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0358  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.41 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1053  FolC bifunctional protein  39.81 
 
 		 416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1371  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  46.3 
 
 		 422 aa  307  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.968541  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0958  dihydrofolate synthase  39.81 
 
 		 416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.245953  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1077  FolC bifunctional protein (tetrahydrofolate synthase) (folylpolyglutamate synthase)  40.5 
 
 		 426 aa  305  7e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.44 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03098  folylpolyglutamate synthase  41.23 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.2 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.2 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2609  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.68 
 
 		 422 aa  302  6.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.2 
 
 		 422 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2693  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.68 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.68 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.68 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.68 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34180  Folylpolyglutamate synthetase protein  46.73 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  42.96 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3814  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  44.88 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02240  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.68 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  43.68 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02200  hypothetical protein  43.68 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2466  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  43.68 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1899  folylpolyglutamate synthetase  44.24 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2714  FolC bifunctional protein  44.39 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.20841  normal  0.0950332 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01207  bifunctional folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  41.45 
 
 		 443 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0159867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>