176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3172 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  36.08 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  34.02 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  33.71 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  33.71 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  34.46 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  32.12 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  32.8 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  33.33 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0879  toluene tolerance family protein  34.66 
 
 		 209 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  32.47 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  30.41 
 
 		 221 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0866  toluene tolerance  34.09 
 
 		 216 aa  104  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2706  toluene tolerance family protein  33.33 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  31.98 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  29.79 
 
 		 219 aa  88.2  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2410  toluene tolerance family protein  31.79 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.136848  normal  0.157116 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  30 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  30 
 
 		 202 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  25.26 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  29.78 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  30.3 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  30.3 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  27.22 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  27.42 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  30.68 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  30.89 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  24.06 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  30.89 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  29.41 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  28.85 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  28.57 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  25.76 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  29.03 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  26.88 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  26.79 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  23.83 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  26.2 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  25.38 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  23.24 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  27.45 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  22.89 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  22.8 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  24.74 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  26.74 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  26.35 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  25.15 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  22.87 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  23.16 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  21.89 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  26.54 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  28.03 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  26.54 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  26.32 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  23.83 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  29.66 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  26.38 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  21.43 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  21.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  21.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  21.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  21.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  21.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  21.43 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  21.43 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  21.43 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  26.13 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  21.43 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  21.43 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  24.04 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  21.43 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  21.43 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  25.41 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  25.77 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  27.42 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  24.87 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  25.71 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  22.22 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  23.49 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  31.58 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  21.16 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  24.73 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  24.05 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  25 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  21.97 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  22.99 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  22.34 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  21.67 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  25.87 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  27.71 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  27.71 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  27.71 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  22.34 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  23.46 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  21.86 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  27.66 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  20.63 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  24.5 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  22.84 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>