190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0558 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  100 
 
 
199 aa  410  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  63.45 
 
 
198 aa  247  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  55.78 
 
 
202 aa  244  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  59.07 
 
 
200 aa  240  7.999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  57.36 
 
 
200 aa  237  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  37.5 
 
 
212 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  33.33 
 
 
201 aa  121  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  34.54 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  32.14 
 
 
210 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  30.41 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  31.47 
 
 
202 aa  101  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  34.1 
 
 
193 aa  100  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  27.5 
 
 
217 aa  99.4  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  29.71 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  27.64 
 
 
204 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  32.12 
 
 
220 aa  95.9  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  28.42 
 
 
202 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  28.42 
 
 
202 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  30.73 
 
 
211 aa  94  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  31.55 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  29 
 
 
224 aa  92.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  30.3 
 
 
213 aa  90.5  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  29.38 
 
 
218 aa  88.6  6e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  30.27 
 
 
198 aa  85.9  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  27.92 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  30.21 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3118  toluene tolerance family protein  28.78 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00282764  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  29.95 
 
 
221 aa  82  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1564  toluene tolerance protein, putative  24.87 
 
 
189 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.831051  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  28.79 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  29.11 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  26.34 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1375  toluene tolerance protein, putative  24.34 
 
 
189 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  29.65 
 
 
215 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0278  putative toluene tolerance protein  24.34 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  27.03 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  28.14 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1282  toluene tolerance  28.14 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  30.32 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  29.06 
 
 
215 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  29.71 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  28.06 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  24.88 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  28.82 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  29.03 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  27 
 
 
219 aa  74.7  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  28.65 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  29.68 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  28.66 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.94 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  26.18 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  26.42 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  27.59 
 
 
204 aa  72  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  28.05 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  27.14 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  27.92 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  26.32 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  28.65 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  26.55 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  26.62 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  26.62 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  25.79 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  29.41 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0365  toluene tolerance protein Ttg2D  25.67 
 
 
199 aa  67.8  0.00000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  26.98 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  28.39 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  25.39 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  25.39 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  28.57 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  29.23 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  25 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  29.23 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  25.58 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  26.42 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  26.37 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0320  toluene tolerance protein Ttg2D  25.13 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.650296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  26.63 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  26.36 
 
 
212 aa  63.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  27.47 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  24.64 
 
 
217 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  25.24 
 
 
220 aa  63.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  24.44 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2706  toluene tolerance family protein  23.27 
 
 
217 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  29.58 
 
 
208 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  27.46 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  22.35 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  22.35 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  26.26 
 
 
209 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  22.35 
 
 
198 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  23.68 
 
 
213 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  22.35 
 
 
198 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  61.2  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  27.46 
 
 
223 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  22.35 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  25.62 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  26.06 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  23.98 
 
 
198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>