193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0689 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  81.6 
 
 		 211 aa  336  1.9999999999999998e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  63.81 
 
 		 218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  67.45 
 
 		 211 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  62.5 
 
 		 219 aa  281  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  62.91 
 
 		 215 aa  278  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  62.44 
 
 		 215 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  68.31 
 
 		 190 aa  272  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  62.93 
 
 		 204 aa  272  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  59.81 
 
 		 222 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  59.9 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  58.17 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  59.05 
 
 		 212 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  50 
 
 		 209 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  51.78 
 
 		 210 aa  214  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  46.73 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  48.77 
 
 		 213 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  52.79 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  47.59 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  54.14 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  46.23 
 
 		 211 aa  203  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  46.7 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  47.26 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  46.12 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  46.12 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  45.15 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  45.15 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  45.15 
 
 		 210 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  46.77 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  45.05 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  44.66 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  44.66 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  44.66 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  48.04 
 
 		 202 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  46.27 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  46.27 
 
 		 210 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  45.77 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  49.71 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  46.03 
 
 		 218 aa  185  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  49.71 
 
 		 211 aa  184  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  49.4 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  46.23 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  41.79 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  44.1 
 
 		 211 aa  168  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  37.56 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  39.51 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  38.54 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  39.23 
 
 		 252 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  39.34 
 
 		 209 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  40.76 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  34.88 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  35.06 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  32.56 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  35.06 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  35.06 
 
 		 198 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  33.72 
 
 		 198 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  32.56 
 
 		 216 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  34.48 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  30.58 
 
 		 217 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  33.72 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  33.72 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  33.72 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  33.72 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  33.72 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  33.72 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  33.72 
 
 		 198 aa  124  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  32.49 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  34.62 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  32.23 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  32.16 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  28.98 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  28.98 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  29.17 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  28.82 
 
 		 222 aa  91.3  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  29.69 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  31.75 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  27.67 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  26.32 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  26.84 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  28.43 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  25.12 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  25.27 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  28.65 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  28.65 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  25.35 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  29.7 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  29.7 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  24.51 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  29.7 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  29.7 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  29.7 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  26.04 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  24.26 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  26.7 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  27.23 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  23.88 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  24.51 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  24.02 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  24.02 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  24.51 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>