161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03208 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  100 
 
 
220 aa  446  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  66.05 
 
 
218 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  66.05 
 
 
218 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  70.62 
 
 
220 aa  278  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  27.23 
 
 
219 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  34.56 
 
 
202 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  27.14 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  27.7 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  26.67 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  26.67 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  26.67 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  26.67 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  26.67 
 
 
211 aa  78.6  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  27.67 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  26.67 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  26.67 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  27.62 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  27.62 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  27.62 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  27.62 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  27.62 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  24.88 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  27.18 
 
 
211 aa  74.7  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  30.51 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  26.82 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  30.06 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  24.7 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  24.7 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  29.19 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  25.23 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  28.93 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  30.06 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  30.06 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  27.56 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25.85 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  27.75 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  23.43 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  24.88 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  28.29 
 
 
214 aa  68.2  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  30 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  28.31 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  25.31 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  28.57 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  25 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  28.11 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  27.56 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  24.6 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  24.6 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  24.6 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  25.83 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  25 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  23.81 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  23.81 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  24.12 
 
 
220 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  25.24 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  24.2 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  23.88 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0866  toluene tolerance  25.91 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  23.15 
 
 
217 aa  62  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0879  toluene tolerance family protein  28.93 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  26.04 
 
 
198 aa  62  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  23.78 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  25.9 
 
 
204 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  23.41 
 
 
213 aa  60.5  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  27.5 
 
 
215 aa  60.1  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  21.79 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 
207 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  25 
 
 
212 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  23.3 
 
 
206 aa  58.5  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  23.77 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03655  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  25.89 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  24.71 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  22.54 
 
 
204 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  24.2 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  24.51 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  22.97 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3118  toluene tolerance family protein  29.63 
 
 
175 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00282764  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  30.49 
 
 
234 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  22.02 
 
 
217 aa  55.5  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  27.62 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  23.74 
 
 
217 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  22.86 
 
 
227 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  26.12 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  22.5 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  24.02 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  25 
 
 
211 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  23.27 
 
 
217 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  25 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  26.47 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  26.87 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  30.33 
 
 
211 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  25.14 
 
 
213 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  25.54 
 
 
211 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  23.53 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  25.84 
 
 
211 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  23.53 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  23.53 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  23.53 
 
 
210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  23.53 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>