90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0141 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 206 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2481  toluene tolerance  51.5 
 
 		 196 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.996005  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2549  toluene tolerance family protein  53.93 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0890  hypothetical protein  53.93 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0117  toluene tolerance family protein  52.24 
 
 		 207 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2034  toluene tolerance family protein  51.06 
 
 		 201 aa  188  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.601085  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  27.5 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  29.66 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  30.15 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  25.12 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  27.44 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  23.16 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  27.52 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  29.5 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  24.84 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  29.12 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  26.28 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  26.47 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  22.52 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  25.55 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  25.55 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  22.98 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  25.55 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  24.49 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  25.55 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  24.24 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  25.36 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  22.73 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  27.01 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  27.01 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  25.63 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  27.01 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  25.2 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  28.02 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  25.13 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  23.61 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  26.28 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  25.55 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  25.55 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  22.92 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  25.55 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  25.55 
 
 		 220 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  25.57 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  25.57 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  25.55 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  27.7 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  24.75 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  25.24 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  23.53 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  23.53 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  23.56 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  28.47 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  24.74 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2410  toluene tolerance family protein  23.33 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.136848  normal  0.157116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  24.82 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  23.39 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  26.02 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  26.02 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  26.02 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  24.6 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  24.6 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  26.72 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0442  toluene tolerance family protein  21.09 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.174385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  24.09 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  24.09 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  24.09 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  24.09 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  24.09 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  24.09 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  21.98 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  24.24 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  27.01 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  21.98 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  23.16 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  23.63 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  24.8 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  26.79 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  23.32 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  21.43 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  25.2 
 
 		 212 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  23.44 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  26.72 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  26.88 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  24.29 
 
 		 222 aa  41.2  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>