59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2481 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2481  toluene tolerance  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.996005  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  51.5 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0117  toluene tolerance family protein  52.04 
 
 		 207 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2549  toluene tolerance family protein  52.57 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0890  hypothetical protein  52.57 
 
 		 207 aa  191  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2034  toluene tolerance family protein  50.52 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.601085  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  25.17 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  25.93 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  30 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  29.63 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  26.07 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  26.19 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  26.07 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  28.89 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  23.86 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  23.56 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  23.56 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  23.56 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  23.56 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  29.37 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  23.59 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  27.94 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  24.29 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  24.87 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  23.71 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  24.8 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  26.47 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  27.56 
 
 		 222 aa  45.1  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  24.09 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  25.41 
 
 		 257 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  23.88 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  21.24 
 
 		 219 aa  44.7  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  23.36 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  23.36 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  23.36 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  20.98 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  23.36 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  23.36 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  23.35 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  23.36 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  24.28 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4019  toluene tolerance family protein  25.93 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.163851  normal  0.13623 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  25.2 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  26.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  23.36 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  23.78 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  24.73 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  21.32 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  22.22 
 
 		 209 aa  42.4  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  21.32 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  21.32 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  24.11 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  21.54 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  20 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  21.54 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  21.54 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  21.54 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  20 
 
 		 212 aa  41.2  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  21.54 
 
 		 211 aa  41.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>