180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2884 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  100 
 
 		 204 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  41.18 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  42.57 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  40.59 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  42.08 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  42.08 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  42.08 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  40.59 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  40.1 
 
 		 217 aa  167  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  42.08 
 
 		 220 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  41.71 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  40.1 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  43.01 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  41 
 
 		 222 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  41.33 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  40 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  39.9 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  41.29 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  34.38 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  38.54 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  37.06 
 
 		 213 aa  148  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  37.11 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  38.92 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  42.7 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  36.14 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  36.04 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  35.05 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  35.05 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  36.6 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  36.6 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  36.6 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  36.6 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  36.6 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03655  hypothetical protein  39.66 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  33.51 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  35.57 
 
 		 209 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  33.51 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  33.51 
 
 		 207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  34.36 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  35.05 
 
 		 211 aa  138  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  34.54 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  34.54 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  34.54 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  34.54 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  34.54 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  34.54 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  34.54 
 
 		 211 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  29.84 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  28.5 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  30 
 
 		 222 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  31.84 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  27.05 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  27.05 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  27.05 
 
 		 210 aa  89.4  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  26.57 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  26.57 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  26.57 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  27.96 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  24.63 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  25.14 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  25.27 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  26.34 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  26.34 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  26.34 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  26.34 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  25.85 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  26.34 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  25.37 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  27.59 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  27.59 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  26.61 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  24.27 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  23.79 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  24.06 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  29.19 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  23.56 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  23.3 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  22.84 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  23.65 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  21.72 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  28.38 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  25.73 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  30 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  21.78 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  22.78 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  23.41 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  23.04 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  24.05 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  27.32 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  24.6 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  24.6 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  20 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  21.08 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  23.94 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  20.57 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  22.05 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  22.05 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  20 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  22.28 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>