189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6437 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  100 
 
 
214 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  68 
 
 
210 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  68.63 
 
 
210 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  68.63 
 
 
210 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  68.63 
 
 
210 aa  292  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  68.14 
 
 
210 aa  290  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  68.14 
 
 
210 aa  290  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  68.14 
 
 
210 aa  290  8e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  66.5 
 
 
210 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  62.56 
 
 
214 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  62.56 
 
 
214 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  65.5 
 
 
210 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  65 
 
 
210 aa  266  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  65 
 
 
210 aa  266  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  64.5 
 
 
210 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  61.58 
 
 
209 aa  256  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  53.27 
 
 
223 aa  237  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  57.21 
 
 
211 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  57.21 
 
 
210 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  44.23 
 
 
210 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  43.41 
 
 
213 aa  184  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  42.5 
 
 
208 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  43.08 
 
 
209 aa  178  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  42.22 
 
 
211 aa  170  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  39.22 
 
 
204 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  44.07 
 
 
212 aa  170  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  43.09 
 
 
211 aa  169  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  43.48 
 
 
211 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  43.48 
 
 
211 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  40.31 
 
 
213 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  40.49 
 
 
218 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  40.31 
 
 
252 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  40.96 
 
 
209 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  41.75 
 
 
211 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  38.46 
 
 
201 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  40.19 
 
 
201 aa  154  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  40 
 
 
219 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  42.22 
 
 
215 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  41.67 
 
 
215 aa  152  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  40.67 
 
 
201 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  44.38 
 
 
220 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  39.47 
 
 
222 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  38.38 
 
 
204 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  38.46 
 
 
218 aa  145  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  39.88 
 
 
190 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  39.55 
 
 
212 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  36 
 
 
212 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  37.17 
 
 
211 aa  129  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  37.43 
 
 
198 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  38.29 
 
 
202 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  36.05 
 
 
198 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  36.05 
 
 
198 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  36.05 
 
 
198 aa  122  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  36.05 
 
 
216 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  36.89 
 
 
209 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  35.09 
 
 
198 aa  121  9e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  35.09 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  35.09 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  36.84 
 
 
198 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  36.84 
 
 
198 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  36.84 
 
 
198 aa  118  6e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  31.66 
 
 
217 aa  117  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  33.33 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  30.14 
 
 
219 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  33.78 
 
 
215 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  31.25 
 
 
222 aa  89  4e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  27.64 
 
 
214 aa  89  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  28.1 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  28.1 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  25.37 
 
 
213 aa  85.1  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  26.21 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  25.98 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  26.47 
 
 
217 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  25.49 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  27.45 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  25.48 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  25.48 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  25 
 
 
220 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  26.09 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  26.09 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  26.09 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  26.09 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  26.09 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  25 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  26.09 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  26.09 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  26.09 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  26.09 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  26.09 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  24.34 
 
 
222 aa  79  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  26.89 
 
 
202 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  27.49 
 
 
211 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  27.18 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  26.58 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  25.6 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>