184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0391 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  96.67 
 
 
210 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  83.33 
 
 
209 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  72.04 
 
 
210 aa  314  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  70.62 
 
 
210 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  70.62 
 
 
210 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  70.62 
 
 
210 aa  310  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  70.14 
 
 
210 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  70.14 
 
 
210 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  70.14 
 
 
210 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  72.17 
 
 
210 aa  297  8e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  72.17 
 
 
210 aa  296  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  71.23 
 
 
214 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  71.23 
 
 
214 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  71.23 
 
 
210 aa  294  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  70.28 
 
 
210 aa  291  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  70.28 
 
 
210 aa  291  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  55.29 
 
 
208 aa  252  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  56.94 
 
 
214 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  57.29 
 
 
209 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  52.63 
 
 
213 aa  234  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  51.9 
 
 
210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  54.14 
 
 
211 aa  221  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  46.04 
 
 
204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  50.28 
 
 
212 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  49.04 
 
 
211 aa  207  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  50.53 
 
 
218 aa  206  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  48.33 
 
 
211 aa  205  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  47.5 
 
 
219 aa  201  7e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  52.87 
 
 
211 aa  201  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  48.89 
 
 
215 aa  198  5e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  49.23 
 
 
223 aa  198  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  47.16 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  47.78 
 
 
215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  46.38 
 
 
211 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  45.41 
 
 
201 aa  193  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  44.71 
 
 
201 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  45.41 
 
 
201 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  45.92 
 
 
222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  44.44 
 
 
252 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  47.73 
 
 
190 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  45.86 
 
 
209 aa  181  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  44.44 
 
 
204 aa  181  8.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  46.63 
 
 
220 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  41.71 
 
 
212 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  40.1 
 
 
218 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  42.44 
 
 
212 aa  170  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  41.15 
 
 
202 aa  167  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  40.5 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  41.15 
 
 
209 aa  161  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  40.12 
 
 
198 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  37.57 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  37.57 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  39.31 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  39.31 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  39.31 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  39.31 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  39.31 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  39.31 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  39.31 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  36.99 
 
 
198 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  36.99 
 
 
198 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  36.99 
 
 
216 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  37.57 
 
 
198 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  36.99 
 
 
216 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  31.98 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  33.85 
 
 
217 aa  118  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  34.71 
 
 
213 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  31.25 
 
 
215 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  33.33 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  30.9 
 
 
222 aa  99.8  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  26.15 
 
 
217 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  26.54 
 
 
217 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  26 
 
 
221 aa  98.6  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  25.87 
 
 
220 aa  98.6  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  27.75 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  25.89 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  25.23 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 
220 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  25.37 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  30 
 
 
202 aa  94  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  25.89 
 
 
212 aa  92.4  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  26.87 
 
 
217 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  24.64 
 
 
217 aa  91.3  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  27.23 
 
 
220 aa  88.6  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  24.27 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  27.04 
 
 
220 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  24.59 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  21.76 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  23.78 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  26.2 
 
 
212 aa  82  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  22.64 
 
 
223 aa  82  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  27.57 
 
 
212 aa  81.3  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25 
 
 
217 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  25.84 
 
 
211 aa  80.1  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>