187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3284 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  100 
 
 
211 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  37.06 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  35.5 
 
 
200 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  36.46 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  34.31 
 
 
202 aa  125  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  34.54 
 
 
199 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  33.5 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  31.13 
 
 
214 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  35.71 
 
 
193 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  32.08 
 
 
215 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  30.81 
 
 
201 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  33.15 
 
 
210 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  26.4 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  31.89 
 
 
204 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  30.64 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  29.57 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  30.64 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  31.79 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  28.5 
 
 
218 aa  88.2  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  37.04 
 
 
234 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  30.77 
 
 
204 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  27.67 
 
 
217 aa  85.9  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  30.3 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  29.78 
 
 
220 aa  84.7  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  27.72 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  29.26 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  27.32 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  31.25 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  31.25 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  27.32 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  30.94 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  26.63 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  26.63 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  31.32 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  29.83 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  23.74 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  23.74 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  29.44 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  27.38 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  27.67 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  28.5 
 
 
211 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  28.07 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  26.98 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  26.98 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  26.98 
 
 
210 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  23.32 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  29.63 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  26.51 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  32.24 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  24.07 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  27.21 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  32 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  26.51 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  26.51 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  23.41 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  32.21 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  30.94 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0320  toluene tolerance protein Ttg2D  28.27 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.650296  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  27.07 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  28.42 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  28.4 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  25.25 
 
 
206 aa  70.5  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7152  toluene tolerance family protein  27.72 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  27.32 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3118  toluene tolerance family protein  30.07 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00282764  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  23.24 
 
 
209 aa  68.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  26.2 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  28.38 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  24.38 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  27.42 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  24.26 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  23.08 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  23.08 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  25.53 
 
 
189 aa  67  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  27.01 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  25.27 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  21.84 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  27.52 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  22.49 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  23.08 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  24.02 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  22.49 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  23.08 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  34 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  27.41 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  26.92 
 
 
213 aa  65.5  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  27.32 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0278  putative toluene tolerance protein  26.34 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  27.41 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  27.41 
 
 
210 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  27.41 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1564  toluene tolerance protein, putative  26.82 
 
 
189 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.831051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  26.9 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  27.41 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  28.5 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  25.15 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1375  toluene tolerance protein, putative  26.26 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6337  toluene tolerance family protein  26 
 
 
224 aa  62  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  25.13 
 
 
209 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  24.58 
 
 
211 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>