187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0810 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  100 
 
 		 212 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  70.14 
 
 		 211 aa  318  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  72.11 
 
 		 190 aa  302  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  67.45 
 
 		 212 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  61.9 
 
 		 219 aa  282  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  67.03 
 
 		 215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  63.49 
 
 		 218 aa  270  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  65.95 
 
 		 215 aa  268  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  63.27 
 
 		 222 aa  262  3e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  66.13 
 
 		 211 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  62.43 
 
 		 212 aa  247  9e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  59.09 
 
 		 204 aa  246  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  59.46 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  50.47 
 
 		 213 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  48.51 
 
 		 210 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  48.36 
 
 		 211 aa  188  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  47.06 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  50.28 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  42.51 
 
 		 208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  40.7 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  46.74 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  41.71 
 
 		 211 aa  167  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  45.41 
 
 		 209 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  41.83 
 
 		 204 aa  164  8e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  40 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  44.02 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  39.68 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  39.81 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  39.81 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  39.81 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  39.41 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  39.32 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  42.46 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  39.32 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  39.32 
 
 		 210 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  42.08 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  38.16 
 
 		 252 aa  147  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  41.95 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  41.4 
 
 		 209 aa  144  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  37.75 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  40.09 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  40.09 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  40.98 
 
 		 210 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  37.25 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  40.49 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  40.49 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  40.49 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  37.24 
 
 		 211 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  36.47 
 
 		 198 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  34.71 
 
 		 198 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  39.02 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  38.41 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  38.41 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  36 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  36.42 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  37.8 
 
 		 198 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  35.88 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  35.88 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  35.88 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  35.88 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  35.88 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  35.88 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  35.88 
 
 		 198 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  37.2 
 
 		 198 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  38.41 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  32.5 
 
 		 219 aa  111  6e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  33.97 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  30.5 
 
 		 217 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  30.65 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  32.21 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  31.11 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  27.5 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  27.5 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  30.77 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  27.32 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  28.73 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  28.73 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  26.37 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  27.51 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  25.96 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  25.96 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  24 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  24.38 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  23.88 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  27.42 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  24.14 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  23.88 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  24.76 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  25.26 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  25.6 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  25.37 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  26.13 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  26.63 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  26.63 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  26.13 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  29.65 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  28.72 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  27.64 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  26.37 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  30.58 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>