172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3097 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  47.37 
 
 
204 aa  197  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  51.11 
 
 
211 aa  194  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  47.46 
 
 
212 aa  178  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  46.95 
 
 
211 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  49.19 
 
 
190 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  43.52 
 
 
219 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  46.99 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  46.99 
 
 
215 aa  164  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  45.41 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  48.33 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  44.89 
 
 
213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  45.36 
 
 
215 aa  160  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  40.72 
 
 
210 aa  158  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  39.6 
 
 
213 aa  157  7e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  39.15 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  39.68 
 
 
209 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  43.58 
 
 
222 aa  152  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  41.15 
 
 
211 aa  151  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  44.94 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  40.87 
 
 
210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  39.11 
 
 
209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  41.11 
 
 
202 aa  145  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  37.38 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  38.94 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  37.98 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  37.98 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  34.98 
 
 
211 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  37.98 
 
 
210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  37.5 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  37.5 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  37.5 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  35.32 
 
 
211 aa  126  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  35.12 
 
 
211 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  34.93 
 
 
218 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  36.76 
 
 
210 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  36.76 
 
 
210 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  36.76 
 
 
210 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  36.27 
 
 
210 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  36.27 
 
 
210 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  36.27 
 
 
210 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  36.27 
 
 
210 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  35.2 
 
 
209 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  35.61 
 
 
211 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  32.68 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  35.12 
 
 
201 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  33.66 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  36.89 
 
 
214 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  32.21 
 
 
201 aa  115  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  32 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  33.33 
 
 
198 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  33.88 
 
 
223 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  33.33 
 
 
198 aa  101  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  33.91 
 
 
216 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  33.9 
 
 
198 aa  101  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  33.52 
 
 
198 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  33.52 
 
 
198 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  33.91 
 
 
216 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  33.52 
 
 
198 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  33.52 
 
 
198 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  33.52 
 
 
198 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  33.52 
 
 
198 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  33.52 
 
 
198 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  33.33 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  33.33 
 
 
198 aa  99.8  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  32.76 
 
 
198 aa  98.2  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  28.81 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  27.72 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  27.72 
 
 
202 aa  90.5  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  32.06 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  29.07 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  30.43 
 
 
221 aa  85.1  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  26.87 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  30.56 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  30.05 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  30.23 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  30.99 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  30.48 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  30.99 
 
 
220 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  30.52 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  30.52 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  29.51 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  30.41 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  26.96 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  26.96 
 
 
217 aa  79  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  30.41 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  29.25 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  27.37 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  29.47 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  23.41 
 
 
208 aa  73.2  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  25.42 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  25.42 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  27 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  26.44 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  26.6 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  25.5 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  27.43 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  28.33 
 
 
215 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>