177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5675 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  100 
 
 
198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  99.49 
 
 
198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  97.98 
 
 
216 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  97.98 
 
 
216 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  96.46 
 
 
198 aa  360  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  95.45 
 
 
198 aa  358  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  86.36 
 
 
198 aa  329  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  87.88 
 
 
198 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  87.88 
 
 
198 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  87.88 
 
 
198 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  87.88 
 
 
198 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  87.88 
 
 
198 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  87.88 
 
 
198 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  87.88 
 
 
198 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  62.81 
 
 
201 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  63.82 
 
 
201 aa  257  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  62.81 
 
 
201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  52.81 
 
 
252 aa  201  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  50.53 
 
 
209 aa  194  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  36.84 
 
 
213 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  41.86 
 
 
211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  41.76 
 
 
211 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  37.5 
 
 
209 aa  147  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  36.9 
 
 
209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  34.74 
 
 
210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  41.28 
 
 
211 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  37.89 
 
 
211 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  35.68 
 
 
208 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  36.87 
 
 
204 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  37.37 
 
 
210 aa  141  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  36.6 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  37.29 
 
 
211 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  37.11 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  37.11 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  37.11 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  37.06 
 
 
204 aa  138  6e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  36.6 
 
 
210 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  36.6 
 
 
210 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  36.6 
 
 
210 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  37.5 
 
 
219 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  38.89 
 
 
218 aa  135  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  36.31 
 
 
213 aa  134  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  39.58 
 
 
210 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  37.89 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  35.75 
 
 
211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  38.51 
 
 
222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  34.78 
 
 
212 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  39.06 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  39.06 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  39.06 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  37.22 
 
 
223 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  38.66 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  34.86 
 
 
212 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  38.54 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  38.54 
 
 
210 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  35.6 
 
 
218 aa  124  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  38.15 
 
 
212 aa  122  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  34.27 
 
 
215 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  34.69 
 
 
202 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  33.71 
 
 
215 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  34.24 
 
 
211 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  35.75 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  35.39 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  32.12 
 
 
209 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  30.05 
 
 
217 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  31.75 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  26.32 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  27.27 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  27.27 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  25.85 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  25.52 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  21.05 
 
 
222 aa  69.7  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  22.65 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  23.04 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  26.6 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  30.83 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  26.63 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  22.46 
 
 
221 aa  62.8  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  24.23 
 
 
209 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  23.94 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  23.94 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  23.94 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  23.94 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  23.94 
 
 
211 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  24.1 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  20.42 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  20.69 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  23.12 
 
 
191 aa  60.1  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  24.21 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  24.21 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  24.21 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  24.21 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  24.21 
 
 
211 aa  59.3  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  25.29 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  23.04 
 
 
211 aa  58.9  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  26.95 
 
 
234 aa  58.9  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  24.59 
 
 
200 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>