179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4167 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4167  putative toluene tolerance family protein  100 
 
 		 209 aa  430  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.351823  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  70.28 
 
 		 252 aa  309  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  55.71 
 
 		 201 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  54.55 
 
 		 201 aa  237  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  55.5 
 
 		 201 aa  236  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4947  toluene tolerance family protein  51.12 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5184  toluene tolerance  51.12 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5675  toluene tolerance family protein  51.12 
 
 		 198 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652085  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4560  toluene tolerance family protein  51.12 
 
 		 198 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.345727  normal  0.0824487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0023  toluene tolerance protein  50.56 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2336  Ttg2 family toluene tolerance protein  50.85 
 
 		 198 aa  190  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3185  toluene tolerance family protein  50.56 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.64656  normal  0.151755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5500  toluene tolerance family protein  50.56 
 
 		 216 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0182725 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  42.23 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  44.86 
 
 		 209 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  42.44 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  43.89 
 
 		 210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2076  hypothetical protein  49.43 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1464  hypothetical protein  49.43 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1103  hypothetical protein  49.43 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1382  hypothetical protein  49.43 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3249  toluene tolerance protein  49.43 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.864168  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3134  toluene tolerance protein  49.43 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2367  hypothetical protein  49.43 
 
 		 198 aa  177  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  44.32 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  44.32 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  44.32 
 
 		 210 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  42.31 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  43.78 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  40.91 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  43.78 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  43.78 
 
 		 210 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  42.72 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  42.23 
 
 		 211 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  46.51 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  45.35 
 
 		 211 aa  167  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  46.47 
 
 		 211 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  43.78 
 
 		 204 aa  166  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  47.09 
 
 		 210 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  43.1 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  45.55 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  46.03 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  46.03 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  38.76 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  46.03 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  45.5 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  44.97 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  41.31 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  40.59 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  39.6 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  39.66 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  42.94 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  43.75 
 
 		 190 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  41.4 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  41.4 
 
 		 215 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  39.61 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  41.62 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  41.4 
 
 		 212 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  44.24 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  36.73 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  35.07 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  38.29 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  35.47 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  36 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  36.57 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  28.5 
 
 		 217 aa  98.2  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  33.33 
 
 		 213 aa  94.7  9e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  27.22 
 
 		 219 aa  85.1  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  29.57 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  25.51 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  24.14 
 
 		 222 aa  71.2  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  22.86 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  33.59 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  23.7 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  23.53 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  26 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  23.71 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  23.71 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  24.14 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  23.98 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  27.14 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  22.78 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  27.47 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1564  toluene tolerance protein, putative  26.36 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.831051  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3453  toluene tolerance family protein  35.14 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal  0.12161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3651  toluene tolerance family protein  35.81 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0501404 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1375  toluene tolerance protein, putative  27.13 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3762  toluene tolerance family protein  35.14 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.990585 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  22.73 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  23.65 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  22.63 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  26.26 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  27.86 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  22.22 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  23.44 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  22.22 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  23.44 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  23.44 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  27.54 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>