188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1830 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  100 
 
 
217 aa  455  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  100 
 
 
217 aa  455  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  51.11 
 
 
212 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  51.11 
 
 
212 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  31.63 
 
 
218 aa  105  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  34.41 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  30.27 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  28.57 
 
 
202 aa  95.5  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  28.43 
 
 
217 aa  92.8  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  28.79 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  29.17 
 
 
219 aa  89  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  27.27 
 
 
204 aa  88.6  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  24.61 
 
 
215 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  28.06 
 
 
206 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  29.27 
 
 
204 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  27.86 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  28.22 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  30.56 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  25.82 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  24.73 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  28.67 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  25.13 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  30.82 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  25.47 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  26.96 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6437  toluene tolerance family protein  28.1 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  27.51 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  23.74 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  28.77 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  25.13 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  26.62 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  22.49 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  30.89 
 
 
203 aa  74.7  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  28.37 
 
 
212 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  24.75 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6626  toluene tolerance protein  26.23 
 
 
223 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.28199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  24.32 
 
 
215 aa  72  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  24.86 
 
 
215 aa  71.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  26.86 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  25.23 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  25.27 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  23.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  30.77 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  23.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  23.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  23.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  23.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  23.53 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  23.94 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  23.58 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  31.91 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  24.18 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0810  toluene tolerance  25.96 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  23.88 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  25.16 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  23.59 
 
 
200 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2939  toluene tolerance  27.15 
 
 
190 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  24.58 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  27.89 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  26.28 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  29.41 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  29.41 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3567  toluene tolerance family protein  22.39 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0176707  hitchhiker  0.0000453682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  24.48 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  23.24 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  25.71 
 
 
209 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  22.75 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  28.68 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  28.68 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  26.43 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  28.68 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  28.68 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  24.19 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  24.19 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  28.68 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  22.05 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  24.61 
 
 
211 aa  63.2  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  29.37 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  27.94 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  22.45 
 
 
213 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  29.27 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  24.87 
 
 
211 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  25.47 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  23.16 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  24.88 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  25.56 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  25.83 
 
 
217 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  24.43 
 
 
252 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  28.46 
 
 
215 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  24.06 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  28.39 
 
 
209 aa  60.1  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  26.95 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  23.78 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>