184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3701 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  25.97 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  29.17 
 
 		 200 aa  89.4  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  29.9 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  27.27 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  31.74 
 
 		 198 aa  84.7  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  27.72 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  28.67 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  28.67 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  25.27 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  30.15 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  30.07 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  30.07 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  24.16 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  23.76 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  23.76 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4533  toluene tolerance family protein  26.32 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.96804  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  27.86 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  24.35 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  28.43 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  27.98 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  27.27 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  30.15 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  29.14 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  31.29 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  26.67 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  26.4 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  27.05 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  24.06 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  23.23 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  22.34 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  27.74 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  24.59 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  24.15 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  25.54 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  21.65 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  23.41 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0508  toluene tolerance protein Ttg2  25.55 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  27.18 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2889  toluene tolerance family protein  29.09 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  0.2054 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  22.83 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  28.89 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  25.6 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  29.09 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  24.11 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  25.44 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  23.2 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  25.56 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  22.04 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  23.83 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  26.36 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  25.12 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  26.36 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  25.99 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  22.45 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  26.63 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  26.63 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  24.81 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  27.54 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  23.04 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  23.04 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  24.46 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  26.36 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  23.04 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  25.58 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  26.73 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  26.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  23.95 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  26.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  26.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  26.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  26.06 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  26.72 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  26.72 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  26.71 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  26.72 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  24.46 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  23.61 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  25.95 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  25.6 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  26.32 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  27.46 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  25.36 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  27.12 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  25.6 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  26.74 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  24.8 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  23.7 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  24.8 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  27.46 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2099  hypothetical protein  26.24 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  24.06 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>