101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1528 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1528  toluene tolerance  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460007  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2398  toluene tolerance family protein  30.2 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038241 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1331  toluene tolerance family protein  30.81 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1155  toluene tolerance family protein  29.81 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1575  toluene tolerance family protein  28.72 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  24.07 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  25.38 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0221  toluene tolerance family protein  28.67 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  24.63 
 
 		 208 aa  62  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  24.15 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  30.39 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  27.14 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  25.12 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  25.89 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  25.91 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  25.39 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  25.62 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1290  hypothetical protein  26.67 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  26.11 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  24.31 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  23.08 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  25 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  23.3 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  27.1 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  22.16 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  26.97 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  23.03 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  23.03 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  21.86 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  22.51 
 
 		 209 aa  52.4  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0982  toluene tolerance  25.45 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  26.45 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  25.69 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  23.84 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1819  toluene tolerance protein  26.29 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1751  toluene tolerance family protein  26.29 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  22.36 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  22.36 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  26.17 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0141  toluene tolerance family protein  25.13 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.906707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0890  hypothetical protein  26.76 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  23.71 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2549  toluene tolerance family protein  26.76 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.642683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2884  ABC-type transporter periplasmic protein  24.64 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.202462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  24.52 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0499  toluene tolerance  23.08 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000019089  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03183  toluene tolerance family protein  23.33 
 
 		 217 aa  48.5  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  29.66 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  21.67 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  22.46 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03208  toluene tolerance protein Ttg2D  23.67 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0117  toluene tolerance family protein  26.06 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  17.65 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  25.62 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  24 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  24.29 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  25.62 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  24.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  24.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2217  toluene tolerance  23.84 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.689884  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  24.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  24.29 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  24.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  24.29 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  24.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  26.72 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  23.38 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  21.83 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2034  toluene tolerance family protein  26.49 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.601085  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  24.07 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  22.54 
 
 		 200 aa  45.1  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  23.98 
 
 		 234 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  22.96 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  22.96 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  22.46 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  24.86 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  25.77 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  22.22 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3367  toluene tolerance family protein  22.11 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.18441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  22.33 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0040  putative ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents auxiliary component  22.94 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.724976  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  23.57 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  26.47 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1773  hopanoid biosynthesis associated membrane protein HpnM  22.52 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2114  hypothetical protein  22.52 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1170  hypothetical protein  21.88 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  18.98 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  25.79 
 
 		 200 aa  42.7  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  25.95 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  23.42 
 
 		 212 aa  42  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  25.63 
 
 		 204 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0069  hypothetical protein  20.49 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>