160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3001 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3001  toluene tolerance family protein  100 
 
 
224 aa  461  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1819  toluene tolerance family protein  28.72 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  27.84 
 
 
200 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3284  toluene tolerance family protein  26.4 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  27.88 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  29 
 
 
199 aa  92.4  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1043  toluene tolerance family protein  26.77 
 
 
202 aa  92.4  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.536898  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  26.49 
 
 
200 aa  89.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2300  hypothetical protein  27.86 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000288537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  27.06 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0451  putative toluene-tolerance, ABC-type export protein  28.14 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000111262  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0855  toluene tolerance family protein  28.98 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.153543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1006  toluene tolerance family protein  29.07 
 
 
193 aa  84  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0777657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  26.26 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2693  toluene tolerance family protein  28.97 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  30.53 
 
 
220 aa  79  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  30.57 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  25.3 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  27.75 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  25 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  29.29 
 
 
218 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2559  toluene tolerance  27.21 
 
 
227 aa  74.7  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.294909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4904  toluene tolerance  26.18 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191997  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  23.12 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  23.12 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  27.1 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2279  toluene tolerance family protein  24.19 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  26.28 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  26.28 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2117  toluene tolerance family protein  25.36 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  27.15 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  27.15 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  27.15 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3701  toluene tolerance family protein  21.65 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  26.49 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  25.74 
 
 
213 aa  64.3  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  26.49 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  26.49 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  26.49 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  26.54 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  22.34 
 
 
209 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1834  toluene tolerance family protein  23.65 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0587  toluene tolerance protein Ttg2D  25 
 
 
198 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  26.07 
 
 
217 aa  62  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0404  toluene tolerance family protein  27.23 
 
 
209 aa  62  0.000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  25.51 
 
 
201 aa  62  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3647  toluene tolerance family protein  30.08 
 
 
211 aa  61.6  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  27.46 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1746  toluene tolerance  23.32 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  27.97 
 
 
217 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1280  conserved hypothetical protein, putative organic solvent tolerance protein  22.28 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  27.82 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0515  toluene tolerance family protein  28.46 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200554  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0451  toluene tolerance protein Ttg2D  28.46 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.098573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1143  hypothetical protein  28.46 
 
 
207 aa  60.1  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  28.89 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  28.89 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  27.74 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  26.76 
 
 
217 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  23.65 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2220  toluene tolerance family protein  23.96 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.882632  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  24.44 
 
 
204 aa  58.5  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  24.32 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2201  toluene tolerance protein Ttg2D  22.73 
 
 
200 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.697054  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  24.32 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0806  hypothetical protein  22.22 
 
 
216 aa  58.2  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  24.32 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  24.32 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  27.56 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  27.56 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  27.56 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0508  toluene tolerance family protein  27.56 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.608816  normal  0.17184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3118  toluene tolerance family protein  26.76 
 
 
175 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00282764  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  27.56 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  27.56 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  27.64 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3628  toluene tolerance family protein  27.48 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0382494  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  22.71 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  26.92 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4230  toluene tolerance family protein  25.93 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0593082  hitchhiker  0.000279421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  26.92 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  25.14 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1375  toluene tolerance protein, putative  21.74 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0975  toluene tolerance family protein  25.62 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.475076  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0278  putative toluene tolerance protein  22.28 
 
 
189 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  24.35 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1564  toluene tolerance protein, putative  22.28 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.831051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3607  toluene tolerance protein Ttg2D  27.56 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.357762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3500  toluene tolerance protein Ttg2D  27.56 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0124432  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  27.56 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3669  toluene tolerance protein Ttg2D  27.56 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.776684  normal  0.0535124 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3502  toluene tolerance protein Ttg2D  27.56 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  26.61 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  26.28 
 
 
209 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  25.14 
 
 
215 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  26.83 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1290  hypothetical protein  24.64 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  24.82 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0320  toluene tolerance protein Ttg2D  20.45 
 
 
195 aa  55.5  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.650296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>