182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0875 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0906  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0875  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0240  toluene tolerance  30.93 
 
 
202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2782  toluene tolerance protein  33.5 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.355408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0763  toluene tolerance family protein  31.74 
 
 
213 aa  117  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0740  toluene tolerance family protein  32.95 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1896  putative signal peptide protein  30.41 
 
 
211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2746  toluene tolerance  29.63 
 
 
218 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0383  toluene tolerance family protein  28.74 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2792  hypothetical protein  30.05 
 
 
217 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3398  toluene tolerance  27.84 
 
 
204 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0100  toluene tolerance family protein  29.52 
 
 
210 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.935243  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3390  toluene tolerance family protein  29.59 
 
 
204 aa  101  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0558  toluene tolerance  29.44 
 
 
213 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.254728  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0892  toluene tolerance family protein  27.27 
 
 
220 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.353613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0797  toluene tolerance  29.12 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0399267  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0099  toluene tolerance family protein  27.8 
 
 
213 aa  97.1  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000057707  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3118  toluene tolerance  30.64 
 
 
209 aa  95.9  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.173337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1830  toluene tolerance protein, putative  28.57 
 
 
217 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1505  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 
217 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.939447  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0689  toluene tolerance family protein  28.9 
 
 
212 aa  95.9  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4138  toluene tolerance  29.47 
 
 
216 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0558  toluene tolerance family protein  28.42 
 
 
199 aa  95.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000502165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0968  toluene tolerance family protein  29.03 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0720  toluene tolerance family protein  29.05 
 
 
215 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0752  toluene tolerance family protein  28.49 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1411  toluene tolerance family protein  29.55 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1017  toluene tolerance family protein  28.72 
 
 
218 aa  92.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2401  toluene tolerance family protein  28.35 
 
 
222 aa  92  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.136041  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2063  toluene tolerance  28.57 
 
 
211 aa  91.7  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2766  toluene tolerance family protein  28.35 
 
 
209 aa  91.7  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3301  toluene tolerance family protein  28.21 
 
 
217 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1158  toluene tolerance family protein  30.11 
 
 
219 aa  91.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.246193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0284  toluene tolerance family protein  28.43 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0879  toluene tolerance family protein  29.3 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27843  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3255  toluene tolerance protein  26.63 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202923  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4254  toluene tolerance family protein  29.12 
 
 
217 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0813  hypothetical protein  26.46 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.975155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3606  toluene tolerance family protein  27.8 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4357  toluene tolerance family protein  27.92 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.551871  normal  0.0129543 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3097  putative toluene tolerance protein  27.72 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.43524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0961  toluene tolerance family protein  29.7 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1000  toluene tolerance family protein  29.7 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4444  toluene tolerance protein, putative  28.65 
 
 
216 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0291  toluene tolerance family protein  27.41 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.269992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12880  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, auxiliary component  27.61 
 
 
215 aa  89  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0533  toluene tolerance family protein  27.6 
 
 
214 aa  89  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0724  toluene tolerance family protein  29.38 
 
 
221 aa  89  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3805  toluene tolerance family protein  27.36 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00422883  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2689  toluene tolerance  29.12 
 
 
214 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000795004  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0418  toluene tolerance family protein  29.12 
 
 
214 aa  88.2  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.768803  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3232  hypothetical protein  27.18 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.475918  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1781  hypothetical protein  27.18 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.17827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2772  hypothetical protein  27.18 
 
 
210 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3699  hypothetical protein  27.18 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0682  toluene tolerance family protein  28.19 
 
 
217 aa  88.2  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.617066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3673  toluene tolerance protein  27.18 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3731  toluene tolerance protein  27.18 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.342762  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0397  toluene tolerance family protein  29.12 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0321  toluene tolerance family protein  29.12 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0119101  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3000  Ttg2 family toluene tolerance protein  26.98 
 
 
210 aa  87.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0736  toluene tolerance family protein  28.5 
 
 
220 aa  87  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3340  toluene tolerance family protein  28.19 
 
 
217 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3951  hypothetical protein  28 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0345  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 
210 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33164 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3516  toluene tolerance  28.57 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759088  normal  0.531481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57840  hypothetical protein  26.55 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0681  toluene tolerance family protein  27.66 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.824061  normal  0.100522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3078  hypothetical protein  28.14 
 
 
212 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5532  toluene tolerance family protein  26.7 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0336  toluene tolerance family protein  28.57 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5025  hypothetical protein  26.67 
 
 
215 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3172  toluene-tolerance protein  30 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.479396  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0016  putative ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  27.37 
 
 
201 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0784  toluene tolerance  23.35 
 
 
200 aa  85.1  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0161  toluene tolerance protein, putative  28.9 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0340  toluene tolerance family protein  28.9 
 
 
212 aa  85.1  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.624229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4132  toluene tolerance family protein  25.79 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7034  toluene tolerance family protein  27.37 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.935648  hitchhiker  0.000000356526 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0404  toluene tolerance family protein  27.92 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3659  toluene tolerance family protein  28.5 
 
 
220 aa  84  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00748433  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2958  signal peptide protein  24.31 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3185  toluene tolerance family protein  25.13 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000983475  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3630  toluene tolerance  28.09 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374645  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0391  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein, toluene tolerance Ttg2D-like  30 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002412  uncharacterized ABC transporter auxiliary component YrbC  29.73 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0716  toluene tolerance family protein  28.5 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03057  predicted ABC-type organic solvent transporter  26.63 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0306447  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0515  toluene tolerance family protein  26.63 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0164928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3679  toluene tolerance protein Ttg2D  26.63 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00332081  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4514  toluene tolerance protein Ttg2D  26.63 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0278375  normal  0.419921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0695  toluene tolerance family protein  28 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0725  toluene tolerance family protein  28.28 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3578  toluene tolerance protein Ttg2D  26.63 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.306027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03008  hypothetical protein  26.63 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0270786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3488  toluene tolerance protein Ttg2D  26.63 
 
 
211 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.674081  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3571  toluene tolerance protein Ttg2D  25.63 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2096  toluene tolerance protein  26.2 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0866  toluene tolerance  27.71 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3236  toluene tolerance family protein  27.33 
 
 
211 aa  82.4  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.379777  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>